NiftyNet“评估”动作输出不正确

时间:2018-04-09 09:39:42

标签: niftynet

我试图在推理后使用新的“评估”操作来为我的输出生成一些指标。但是,对于我的每个数据卷,.csv文件只显示average_distance的得分为'0',对于Jaccard和Dice只显示'1'。我似乎找不到评估行动的任何文件,所以我不确定我做错了什么。此外,--dataset_to_infer=Validation选项似乎不起作用,推理和评估都应用于所有数据而不仅仅是验证集。

谢谢!

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

对于评估问题,我们正在处理文档。 dataset_to_infer选项仅针对NiftyNet/niftynet/application中的应用程序进行了测试;来自模型动物园的应用程序尚未升级以支持它(如果您认为这是一个错误,请提交更多详细信息https://github.com/NifTK/NiftyNet/issues的问题)。

答案 1 :(得分:0)

暂时,直接指向config.ini中的推理结果对我有用。

例如
[inferred] csv_file = model_dir/save_seg_dir/inferred.csv

我认为当前找不到此文件,然后评估默认为将标签与标签进行比较。请参阅GitHub上的issue