R - data.tree沿着叶子的祖先聚合?

时间:2018-03-28 08:23:59

标签: r tree aggregate

背景:假设我有一个决策树,其中包含节点结果发生的概率。我需要计算每个叶子上每个最终结果的联合发生概率。

方法:我尝试使用R中的data.tree沿树的每个叶子的祖先聚合。

问题:我是data.tree的初学者,并且不知道这是否可能。

这是一个例子(使用sum而不是prod作为聚合,因为它更容易手动计算):

library(data.tree)
set.seed(123)
# Create a tree
thetree <- CreateRegularTree(height = 3, branchingFactor = 2, parent = Node$new("1"))
thetree$Set(p = 1:thetree$totalCount/10)
print(thetree, "p")
#       levelName   p
# 1 1             0.1
# 2  ¦--1.1       0.2
# 3  ¦   ¦--1.1.1 0.3
# 4  ¦   °--1.1.2 0.4
# 5  °--1.2       0.5
# 6      ¦--1.2.1 0.6
# 7      °--1.2.2 0.7

我尝试了聚合功能

# But this returns aggregations across all children on each level
thetree$Do(function(x) x$result <- Aggregate(x, "p", sum))
print(thetree, "p", "result")

#       levelName   p result
# 1 1             0.1    0.7
# 2  ¦--1.1       0.2    0.7
# 3  ¦   ¦--1.1.1 0.3    0.3
# 4  ¦   °--1.1.2 0.4    0.4
# 5  °--1.2       0.5    1.3
# 6      ¦--1.2.1 0.6    0.6
# 7      °--1.2.2 0.7    0.7

我也尝试了traversal = "ancestor"论证但没有成功。

我想要的结果涉及沿着从祖先到每片叶子的每条路径的聚合,如 - 叶子1.1.1。 - 例如,0.3 + 0.2 + 0.1。

# Desired result
#       levelName   p result
# 1 1             0.1    NA
# 2  ¦--1.1       0.2    0.3
# 3  ¦   ¦--1.1.1 0.3    0.6
# 4  ¦   °--1.1.2 0.4    0.7
# 5  °--1.2       0.5    0.6
# 6      ¦--1.2.1 0.6    1.2
# 7      °--1.2.2 0.7    1.3

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

为此,Do派上用场了:

thetree$result <- thetree$p
traversal <- Traverse(thetree, filterFun = isNotRoot)
Do(traversal, function(node) node$result <- node$parent$result + node$p)

然后得到所需的结果:

print(thetree, "p", "result")
      levelName   p result
1 1             0.1    0.1
2  ¦--1.1       0.2    0.3
3  ¦   ¦--1.1.1 0.3    0.6
4  ¦   °--1.1.2 0.4    0.7
5  °--1.2       0.5    0.6
6      ¦--1.2.1 0.6    1.2
7      °--1.2.2 0.7    1.3