通过rpy2从Python中的bitbucket安装自定义R包

Question

我在Python中使用rpy2包。我正在寻找一种从bitbucket安装自定义R包的方法。我已经能够在R中通过

安装相同的包

library(devtools)
install_bitbucket("myrepo", auth_user="xyz", subdir = "abc", password="123")

在Python中，我正在寻找这样的东西，如果可能的话：

import rpy2.robjects as ro
from rpy2.robjects.packages import importr
import rpy2.robjects.packages as rpackages
devtool = rpackages.importr('devtools')
devtool.install_bitbucket("myrepo", auth_user="xyz", subdir = "abc", password="123")

寻求帮助以正确安装软件包并使用其自定义功能。 感谢

Answer 1

这对我有用：

1. 通过导入utils安装devtools
2. 通过导入devtools从bitbucket安装我的包。

这可能听起来微不足道，但这是我现在能想到的最好的。 这是源代码：

import rpy2.robjects as ro
from rpy2.robjects.packages import importr
import rpy2.robjects.packages as rpackages
utils = rpackages.importr('utils')
devtools = utils.install_packages('devtools')
d = {'package.dependencies': 'package_dot_dependencies',
     'package_dependencies': 'package_uscore_dependencies'}
custom_analytics = importr('devtools', 
                   robject_translations = d)
abc = custom_analytics.install_bitbucket("myrepo", auth_user="xyz", subdir = "abc", password="123")

abc = importr('abc', 
                   robject_translations = d)