使用rpy2安装本地软件包-无效的软件包

Question

我正在尝试运行本地r包并存储返回的结果。

我将R包与python脚本放在同一目录中。我已经从importr导入了rpy2.robjects.packages，并且已经导入了utils软件包。

当我这样调用install.packages

from rpy2.robjects.packages import importr
utils = rpackages.importr('utils')
utils.install_packages('impactr_3.gz', repos = NULL, type="source")

产生的错误是：

NameError: name 'NULL' is not defined.

如何使用rpy2加载此本地R包？

Answer 1

除非您定义它，否则Python将不知道任何NULL（因此出现错误）。如果要使用R的NULL，则可以将其查找为rpy2.robjects.NULL或rpy2.rinterface.NULL。

否则，要使用的R函数的文档指出，路径也可以指定为前缀file://：

utils.install_packages('file://impactr_1.0.1.tar.gz', type = "source")