R笔记本：在报告中包含数字并保存图表

Question

我正在使用R笔记本，我喜欢我的图表在代码运行时自动保存到磁盘，以及显示内联。

knitr: include figures in report *and* output figures to separate files为R Markdown解决了这个问题，但给出的解决方案并不适用于R笔记本。 R笔记本有类似的选择吗？

Answer 1

尝试设置knitr fig.path选项：

knitr::opts_chunk$set(fig.path = "path/to/figures/")

其中path/to/figures/是保存数字的子目录的路径。尾随斜线是必要的。这应该是相对路径，相对于RNotebook文件或项目目录。有关查找项目目录的便捷方法，请参阅here::here()。

这会将每个数字放入该目录;图名称将基于块名称（因此请命名您的块！）

Answer 2

这最终对我有用（请参阅@TCZhang对我的问题here的回答）：

除了设置@DonJ建议的编织块fig.path="figures/"选项外，请尝试设置output: html_document，或仅按顶部Preview [Notebook]按钮旁边的下拉菜单，然后按{{ 1}}。我认为这不起作用的原因是您的输出设置为Knit to HTML。

我不知道为什么当文档为R Notebook格式时，这种方法不能特别有效。如果此方法适用于output: html_notebook，我也希望，所以这可能是我们需要使用RStudio或knitr打开的问题。