在Ubuntu中从R脚本调用bash

Question

我想使用system调用bash

在R中运行以下代码

> cat(test[[1]])
gpt /shared/Training/Bulk_with_R/AuxData/Graph.xml -Pinput1=/shared/Training/Bulk_with_R/Original/S2A_MSIL2A_20170604T112121_N0205_R037_T29TNE_20170604T112755.SAFE/MTD_MSIL2A.xml -Ptarget1=/shared/Training/Bulk_with_R/Processing/20170604.dim

如果我跑

system(test[[1]])

我收到以下错误：

> system(test[[1]])
sh: 1: gpt: not found

我想这是因为R没有使用正确的shell。如果我使用echo $0检查终结中使用的那个，则输出为bash

有关如何解决此问题的任何想法？