R icenReg包：移动ic_np fit

Question

我需要创建一个比较三种物种的区间删失生存曲线的图。我能够使用R中ic_np包中的icenReg函数生成一个显示所有三条曲线的图。当我使用基础R {{1绘制此ic_np拟合的输出时}，一个图例出现在左下角。

plot()包文档中的这个示例产生了类似的数字：

icenReg

但是，左下角的标题涵盖了我生存曲线最有趣的比较，所以我想将图例移到右上角。

我已经看到this question关于为基础R中的基本图设置图例位置。这个问题的答案似乎假设我可以生成没有图例的情节，但我无法做到这一点。

我还看到this question关于向其他类型的生存分析添加图例，默认情况下似乎没有生成图例，但我无法使用区间删失数据实现这些方法。

我已经读过，我无法移动已经添加到情节中的传奇，但我不知道如何生成这个特定情节没有一个传奇所以我可以在我想要的地方添加一个（右上角）。

我怎样才能（a）使用library(icenReg) data(miceData) fit <- ic_np(cbind(l, u) ~ grp, data = miceData) #Stratifies fit by group plot(fit) 生成间隔删除的Kaplan-Meier生存曲线图而不使用图例 - 可能使用ic_np的一些隐藏参数 - 或者（b）生成这个数字使用不同的绘图设备，假设情节图例是可移动的？

Answer 1

在绘图函数的包中似乎没有帮助页面，因此您需要确定fit - 对象的类并查看代码：

class(fit)
#[1] "ic_npList"
#attr(,"package")
#[1] "icenReg"

 plot.ic_npList
#Error: object 'plot.ic_npList' not found

所以它不会被导出，我们需要深入挖掘（不要太惊讶，因为导出的函数需要有帮助页面。）

 getAnywhere(plot.ic_npList)
#-----------
A single object matching ‘plot.ic_npList’ was found
It was found in the following places
  registered S3 method for plot from namespace icenReg
  namespace:icenReg
with value

function (x, fitNames = NULL, lgdLocation = "bottomleft", ...) 
{
    addList <- list(xlim = x$xRange, ylim = c(0, 1), xlab = "time", 
        ylab = "S(t)", x = NA)
    dotList <- list(...)
   #.........
#..........
    legend(lgdLocation, legend = grpNames, col = cols, lty = 1)
}
<bytecode: 0x7fc9784fa660>
<environment: namespace:icenReg>

因此，图例位置有一个位置参数，而尝试的明显替代方法是：

plot(fit, lgdLocation = "topright")