我有一个.Matrix文件，我被告知它类似于.csv文件，我看一下网页浏览器，它看起来像这样：
%TransMat_H0004.E1.L1.S1.B1.T1
CLUSTER ,, 3,3,2,2,1,1,3,1,1,1,1,3,2,3,1,2,2,1,1,3,3,1， 2,1,3,1,1,2,1,3,3,2,3,3,1,1,1,1,1,3,3,1,2,3,2,1,1， 1,1,2,1,2,2,3,1,3,2,2,2,1,3,3,2,3,3,1,2,3,3,2,2,2， 3,2,2,2,1,1,2,1,1,2,1,1,1,1,2,3,1,3,2,3,3,3,3,2,1， 1,3,3,3,1,1,1,2,1,3,1,2,1,1,1,1,1,1,1,3,1,3,2,3,1， 1,3,2,2,3,3,1,3,1,1,2,1,2,2,1,1,3,3,1,2,1,2,2,2,2， 2,1,3,1,2,3,2,2,2,2,3,2,1,1,2,3,3,2,1,3,1,1,1,1,3， 3,3,1,3,3,1,2,2,3,2,3,2,2,3,1,2,2,1,3,1,2,2,3,1,2， 3,2,3,3,1,3,2,3,1,1,2,3,1,1,3,2,1,2,1,1,3,1,1,3,1， 1,2,1,2,2,2,3,1,3,3,3,1,3,1,1,3,2,3,1,3,2,1,3,1,1， 1,2,3,3,3,1,3,3,3,1,1,2,2,3,2,3,3,3,1,3,3,1,1,2,3， 2,1,1,3,1,1,1,1,1,3,3,2,2,1,1,1,1,1,3,1,1,2,3,3,1， 1,3,2,2,1,1,2,1,1,3,2,1,2,1,2,3,2,1,1,3,2,1,3,2,1， 2,2,1,3,3,1,3,3,2,3,2,3,1,3,3,3,3,2,1,3,2,3,3,3,2， 1,2,1,2,3,1,1,3,3,3,3,3,2,3,3,1,3,1,1,2,3,3,3,3,3， 3,2,2,2,3,1,2,3,3,3,3,2,1,2,2,3,2,3,2,3,2,3,3,2,1， 2,3,3,2,1,2,3,3,3,1,3,2,3,3,1,2,2,3,1,1,2,2,3,2,1， 1,2,2,1,3,1,2,3,1,3,1,1,2,3,3,1,2,3,2,2,1,1,2,3,2， 2,2,1,2,1,2,2,3,2,1,2,1,3,1,2,3,1,2,3,1,2,1,1,2,1， 3,3,3,1,3,3,2,2,2,1,2,3,1,3,1,2,1,3,1,2,2,1， 2,3,1,1,3,3,2,2,3,1,1,2,1,1,1,2,1,2,3,3,2,2,1,2,3， 2,3,1,2,2,2,1,3,3,3,3,3,3,2,3,2,1,2,1,3,3,1,3,3,1， 3,2,3,3,1,2,3,3,3,3,3,1,2,1,2,1,1,1,1,2,2,3,1,1,2， 3,2,3,2,2,3,3,1,2,1,3,2,3,2,2,3,2,3,1,1,1,3,1,2,3， 1,3,2,3,2,2,1,2,3,1,3,2,1,2,3,1,3,1,2,2,1,3,3,2,1， 3,3,1,2,3,1,2,1,1,3,1,3,2,3,3,3,3,2,2,1,1,3,3,2,1， 3,1,1,3,3,3,1,3,3,1,1,3,3,3,1,1,3,3,2,1,3,2,3,1,3， 2,2,2,2,2,3,3,1,2,2,3,2,3,3,1,3,1,3,3,1,3,2,1,2,3， 1,3,1,3,2,2,1,1,1,1,3,2,3,3,2,2,3,2,3,1,3,2,1,2,3， 1,2,2,1,1,1,3,3,2,3,3,3,3,2,3,1,1,3,3,3,1,1,3,2,1， 2,3,2,3,1,3,3,2,1,1,1,1,3,3,2,3,1,2,1,3,3,3,2,2,2， 2,3,3,1,1,2,3,2,2,3,3,2,2,3,3,3,2,2,1,2,2,3,3,3,3， 1,2,2,3,2,2,2,2,3,2,2,2,1,1,2,2,2,1,2,3,2,2,3,3,2， 1,3,1,2,2,1,3,2,3,1,1,3,1,2,2,2,3,3,1,3,3,1,2,1,2， 3,1,3,2,3,1,1,3,3,3,1,2,3,3,3,1,3,3,1,3,2,2,2,3,2， 1,2,3,3,2,1,2,1,2,1,1,3,3,1,1,3,2,1,3,2,1,3,3,3,2， 2,2,1,3,2,3,2,3,1,2,3,1,3,3,1,1,3,2,1,2,3,2,1,1,2， 3,1,3,2,1,2,2,3,2,2,1,3,2,1,1,3,3,2,1,3,1,2,2,1,2， 2,3,2,2,2,3,1,1,3,3,3,3,1,2,2,3,3,3,2,1,3,2,1,2,3， 3,1,3,2,1,2,1,1,2,2,3,2,2,3,1,2,3,2,3,1,2,3,3,2,3， 3,1,1,2,1,1,1,3,1,3,1,3,3,2,3,1,2,2,1,2,3,3,2,3,2， 3,2,1,1,3,2,3,2,3,1,1,3,1,3,2,1,3,2,2,2,3,1,1,2,3， 1,1,1,2,3,3,3,1,2,3,3,3,3,2,3,1,3,1,3,2,3,2,3,3,1， 1,2,3,1,1,3,3,2,3,3,1,2,3,1,2,3,3,2,3,3,2,1,2,3,3， 2,3,1,2,2,3,1,2,1,3,2,3,1,2,2,3,3,2,2,3,1,3,3,3,3， 2,3,2,2,1,3,1,2,1,1,1,3,2,3,1,1,1,1,3,3,2,3,1,1,2， 1,3,1,2,3,3,2,2,1,1,3,2,2,3,1,2,3,3,3,2,1,2,2,3,1， 3,3,2,1,2,2,3,3,2,2,3,2,1,1,3,1,3,3,1,3,2,3,3,3,1， 1,1,3,1,2,2,3,2,3,2,3,1,1,2,1,2,1,3,3,1,3,3,2,2,1， 3,1,2,2,3,2,2,2,3,3,2,1,1,1,1,3,1,1,2,1,2,2,3,3,2， 3,3,3,2,1,1,3,2,2,2,3,1,3,3,3,2,2,3,1,3,3,3,1,3,3， 3,2,3,1,2,1,1,3,1,2,3,2,1,3,3,2,1,3,2,3,2,3,1,2,2， 3,3,2,3,3,3,1,2,3,3,3,3,3,1,1,2,3,1,2,1,1,1,1,2,1， 1,2,3,1,3,3,2,2,3,2,2,1,3,2,2,3,1,1,1,1,1,3,1,3,1， 1,3,2,2,3,3,3,1,2,2,3,3,2,3,2,3,3,2,1,2,3,3,1,3,1， 2,1,1,2,2,2,2,2,2,1,3,1,3,2,3,2,2,2,2,2,3,2,2,1,3， 1,1,1,2,1,2,1,2,1,3,1,3,3,1,3,1,3,3,1,3,2,3,3,3,3， 1,3,3,2,3,2,3,3,3,1,1,2,2,3,3,3,2,2,3,3,1,3,1,2,1， 2,2,1,1,3,3,1,1,3,1,1,1,2,2,3,2,2,2,3,3,1,2,1,2,2， 2,3,2,2,1,2,1,1,1,3,3,3,2,1,3,3,3,2,2,3,1,2,1,3,1， 3,3,1,3,2,3,2,2,1,1,1,3,3,2,3,1,3,2,2,2,2,2,3,1,3， 2,3,1,3,1,3,1,2,3,2,2,3,3,3,3,3,1,1,2,3,3,2,3,1,3， 3,1,3,3,2,2,1,3,3,3,3,2,1,3,2,2,2,3,3,1,1,3,3,3,1， 3,1,1,2,3,1,3,3,3,2,1,3,1,2,1,3,2,2,3,1,3,1,2,3,3， 3,2,2,3,1,2,1,1,1,2,3,1,2,3,2,3,3,2,1,1,2,3,3,1,2， 3,1,1,1,3,1,2,3,1,2,3,2,2,3,2,3,2,3,1,2,3,3,1,3,3， 2,2,1,1,2,3,2,2,3,3,2,1,1,1,3,3,3,2,2,1,3,2,2,1,3， 2,3,3,1,1,3,2,3,3,2,3,1,3,3,1,3,3,2,3,3,2,3,1,3,3， 3,3,3,1,1,3,2,2,3,3,3,3,1,1,1,1,3,2,3,3,1,3,2,2,1， 1,1,1,3,2,2,3,2,2,3,3,2,3,1,1,1,3,3,3,3,2,3,1,3,3， 1,1,3,3,1,3,3,3,1,3,2,1,1,3,3,2,3,3,3,2,2,1,3,3,3， 1,2,2,2,2,1,2,2,1,2,3,2,1,2,2,3,3,3,3,3,2,2,3,2,2， 3,2,1,3,1,1,2,2,3,1,2,3,2,1,3,1,1,2,1,2,2,3,1,2,2， 3,3,1,3,2,1,3,3,2,1,3,3,3,1,3,2,3,3,2,3,2,2,3,2,1， 3,3,3,3,2,1,3,3,3,1,3,3,1,3,1,3,3,3
tSNE-1，，8.13846968090103,12.8635212043927,10.3864480425066,7.17083119797853，-72.7452686458686，-49.7960088439495,45.63460621346，-50.3693843293848，-53.2415432674881，-54.6891175204711，-46.4635164735514,4.49644447816871,3.98243750756555，-9.99729157677144，-98.1041739031645,14.4129117311442,21.8090838800674， -46.5547640077783，-65.8379505581324,39.8907136841164,45.2453417297103，-43.4054353275594,5.58370171555427，-82.6419520577671,42.7647608862027，-91.125151907502，-37.9838559192307,62.9924569510685，-69.108888726706,62.7774653919852,60.3873481045592,62.825
我尝试通过read.csv阅读它：
test = read.csv（＆＃39; TransMat_H0004.E1.L1.S1.B1.T1.Matrix＆＃39;，sep =＆＃39;＆＃39;）
STR（试验） ＆＃39; data.frame＆＃39;：33141 obs。 1个变量： $ X.TransMat_H0004.E1.L1.S1.B1.T1：因子w / 33141水平＆＃34; A1BG，0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0， 0,0,0,0,0,0,0,1,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,1,0,0,0， 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0＆＃34; | 截断，..：13453 31099 31100 1 2 3 4 5 6 7 ......
我应该如何以正确的格式阅读它，例如，＆＃39;序列的第一个字符＆＃39;（列表？我猜？）作为rowname。
提前致谢！
抱歉，我无法提供数据链接，因为它未发布;但我可以告诉你数据是什么样的：%TransMat_H0004.E1.L1.S1.B1.T1
cluster,1,2,3,2,3….
tsne-
1,-41,-80…..
tsne-
2,-41,-80…..
tsne-
3,-41,-80…..
(and the rest are all started with gene name and number, such as)
genea, 0,2,1,0…
….
genez,0,2,1,0
我想要的输出是删除前4个因子（cluster，tsne-1，tsne-2，tsne-3），并提取基因转录物矩阵，例如：
V1 V2 V3 V4 V5
1 0 0 0 0 0
2 0 0 0 0 0
3 0 0 0 0 0
4 0 0 0 0 0
5 0 0 0 0 0
答案 0 :(得分：0)
我这样想：
read.csv("E2.Matrix", skip=1)
因为第一行是根据安排.Matrix文件的bioinfor技术人员的注释
谢谢！ @ Stephan