如何在R中仅绘制大型社区/群集

Question

我在g中有一个igraph。由于图形很大，我只想绘制超过10个成员的社区，但我想在一个图中绘制它们。 我想删除不需要的元素是：

g <- delete_vertices(g, V(g)[igraph::clusters(g)$csize < 10])

但由于某些原因，这会绘制很多单个节点，这与我试图实现的相反。你能告诉我我哪里错了吗？

Answer 1

你的想法很棒，但问题在于

igraph::clusters(g)$csize < 10

仅返回包含少于10个成员的群集的逻辑向量。同时，您需要知道哪些顶点属于这些簇。

因此，我们可以按照以下步骤进行。

set.seed(1)
g1 <- erdos.renyi.game(100, 1 / 70)
cls <- clusters(g1)
cls$csize
#  [1]  1  1 43  2 11  1  1  1  2  1  2  5  1  1  4  4  1  1  1  1  2  1  2  1
# [25]  4  1  1  1  1  1 # Two clusters of interest
g2 <- delete_vertices(g1, V(g1)[cls$membership %in% which(cls$csize <= 10)])
plot(g2)