我非常喜欢clusterprofiler包中的dotplot函数。由于某些原因与该程序自身创建的对象相关,我无法使用我的数据复制此图形。
所以我的问题是,是否有人可以指向类似的dotplot包/函数来实现相同的情节? 对我来说,重要的是要展示其中的一些生物过程"存在于某些簇(x轴)中而不存在于其他簇中,并且点的颜色表示其重要性(折叠)。点的大小将由整数表示。
这里是我要展示的数据示例。 提前谢谢。
biological process cluster1-fold cluster2-fold cluster3-fold cluster1-num cluster2-num cluster3-num
cell cycle 0 3 5 0 23 24
dna replication 4 2 0 43 22 0