带有boxplot组摘要的Dotplot

时间:2013-11-11 07:28:13

标签: r ggplot2

我正在按两个类别绘制数据,首先是基础数据:

library(plyr)
library(ggplot2)

d1 <- data.frame(v1 = rnorm(30),
                  x = rep(letters[1:6],  
                          c(6, 3, 8, 3, 4, 6)),
              group = rep(paste("g", 1:3, sep = ""),
                          c(9, 11, 10)))

然后我订购因素

of <- ddply(d1, .(x), function(i) mean(i$v1))
of <- of[order(-of$V1),]
d1$x <- factor(d1$x, levels = of$x)

这提供了以下情节

ggplot(d1) + geom_point(aes( x = v1, y = x)) + 
             facet_grid(group ~ .,
                        scales = "free_y",
                        space = "free_y")

First plot without total summaries

但是我还想为每个组添加一个单独的水平箱图,描绘相关的分布。我知道第一步是在y轴上提供一个“总计”空间:

d2 <- rbind(d1, 
        data.frame(v1 = NA,
                    x = "Total",
                group = unique(d1$group)))

 ggplot(d2) + geom_point(aes( x = v1, y = x)) + 
              facet_grid(group ~ .,
                         scales = "free_y",
                         space = "free_y")

其中提供了以下内容,而且我在这里

plot with total spot on y axis.

我只想在“Total”轴中断旁边有一个水平箱图,总结每个组的数据。

提前致谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

起点是制作两个数据框 - d1作为原始数据框,d2,其中x值全部为Total

d2 <- d1
d2$x <- "Total"

然后使用d1制作积分,d2制作箱图。以下是框图的垂直对齐示例,其中x值用作x。问题是要使用水平箱图,您必须使用coord_flip()。翻转轴和自由刻度不能一起使用。

ggplot()+geom_point(data=d1,aes(x=x,y=v1))+
  geom_boxplot(data=d2,aes(x=x,y=v1))+
  facet_wrap(~group ,
             scales = "free_x")

enter image description here

要获得所需方向的解决方法是制作三个单独的图(每个组一个),然后将它们与grid.arrange()一起放入库gridExtra。对于第一个和第二个图,我删除了x轴的所有刻度,文本和标题。

library(gridExtra)

p1<-ggplot()+geom_point(data=subset(d1,group=="g1"),aes(x=x,y=v1))+
  geom_boxplot(data=subset(d2,group=="g1"),aes(x=x,y=v1))+
  coord_flip()+
  facet_grid(group~.)+
  scale_y_continuous(limits=c(-2,2.5))+
  theme(axis.title.x=element_blank(),
        axis.text.x=element_blank(),
        axis.ticks.x=element_blank())

p2<-ggplot()+geom_point(data=subset(d1,group=="g2"),aes(x=x,y=v1))+
  geom_boxplot(data=subset(d2,group=="g2"),aes(x=x,y=v1))+
  coord_flip()+
  facet_grid(group~.)+
  scale_y_continuous(limits=c(-2,2.5))+
  theme(axis.title.x=element_blank(),
        axis.text.x=element_blank(),
        axis.ticks.x=element_blank())

p3<-ggplot()+geom_point(data=subset(d1,group=="g3"),aes(x=x,y=v1))+
  geom_boxplot(data=subset(d2,group=="g3"),aes(x=x,y=v1))+
  coord_flip()+
  facet_grid(group~.)+
  scale_y_continuous(limits=c(-2,2.5))

grid.arrange(p1,p2,p3)

enter image description here