NetworkX：中心点

Question

我有一个简单的网络，其中有多个不同的“源”连接到一个特定节点。消息来源之间没有边缘。

我正在尝试绘制一个漂亮的圆形图，其中该特定节点在中心处死亡，并且所有源节点整齐地位于围绕该中心节点的圆中，与其具有相同的距离（即半径） 。距离本身没有定义，应该相对于figsize。

我设法将目标节点放在中心，并设法让其他节点形成一个漂亮的圆圈，但不能同时形成两个节点。那就是：

或：

我要做的是将红色节点放在中心。

以下是用于创建图表和图表的代码：

import pandas as pd
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline

n = 283
n_new = 41

df = pd.DataFrame({'source': range(1, n+1),
                   'target':[0]*n,
                   'new_user':[0]*(n-n_new) + [1]*n_new
})

G = nx.from_pandas_dataframe(df, source='source', target='target', create_using=nx.DiGraph())

第一个情节：

plt.figure(figsize=(16,16))

# Node colors
val_map = df.iloc[:,:2].set_index('source').to_dict()['new_user']
val_map[0] = 2
values = [val_map.get(node, 0.25) for node in G.nodes()]

pos = nx.circular_layout(G, scale=2)

node_sizes = [1000] + [200]*283

nx.draw(G, cmap=plt.get_cmap('jet'), node_color=values, font_size=18,
        alpha=0.4, node_size=node_sizes, arrows=True,
               pos=pos)

第二个情节：

plt.figure(figsize=(16,16))

# node colors
val_map = df.iloc[:,:2].set_index('source').to_dict()['new_user']
val_map[0] = 2
values = [val_map.get(node, 0.25) for node in G.nodes()]


# Nodes layout/ position
fixed_positions = {0:(0,0)}
fixed_nodes = fixed_positions.keys()
pos = nx.spring_layout(G,pos=fixed_positions, fixed = fixed_nodes, k=15)
# pos = nx.circular_layout(G, scale=2)

node_sizes = [1000] + [200]*283

nx.draw(G, cmap=plt.get_cmap('jet'), node_color=values, font_size=18,
        alpha=0.4, node_size=node_sizes, arrows=True,
               pos=pos)

感谢您的帮助！

Answer 1

因此函数nx.circular_layout将值分布在原点（0,0）周围的半径为scale的圆上：

  

scale：float（默认值为1）       位置的比例因子，即圆的半径。

所以你需要做的就是定位源节点，在这种情况下是原点的节点0：

pos[0] = np.array([0, 0])

用pos = nx.circular_layout(G, scale=2)

做你的第一个情节

或者甚至更好，首先将节点围绕圆圈定位而不考虑源，然后添加源：

pos = nx.circular_layout(list(range(1,284)), scale=2)
pos[0] = np.array([0, 0])

这会略微改善您的绘图：