将Rmarkdown变量传递给Bash时无法删除文件夹路径

Question

我试图通过在我的Rmarkdown中使用filepath代码块来删除定义为R变量bash的文件夹路径。

从previous question以及Yihui＆​​＃39; example跟进，我将变量filepath传递到bash块中，其中包含以下R代码块：

```{r}
Sys.setenv(FILEPATH = filepath)
```

虽然我能够在echo块中bash我的变量，但当我尝试rm -r我的$FILEPATH变量时出现错误。

```{bash}
echo $FILEPATH
rm -r $FILEPATH
```

  

〜/ Projects / test_threshold

     

rm：〜/ Projects / test_threshold：没有这样的文件或目录

我已经尝试直接在bash终端中分配我的变量以进行删除，并且它有效。

deletedir=~/Projects/test_threshold
rm -r $deletedir

对我做错了什么的任何建议？谢谢你的帮助！

Answer 1

为什么不从R中删除它？

```{r}
system("rm -r $FILEPATH")
```

Answer 2

使用绝对路径，例如/home/users/seanm/Projects/test_threshold，而不是使用代字号（最好留给人类使用。）并始终引用您的变量。

使用此脚本查看出现问题的示例：

cd ~
mkdir foobar
ls ~/foobar
a="~/foobar"
echo "$a"
ls "$a"

你会看到这个输出：

 
~/foobar
-bash: cd: ~/foobar: No such file or directory