如何获得诱导子图的对称邻接矩阵?

时间:2018-02-15 20:45:31

标签: python igraph

4个顶点上的完整图形表示为边缘列表,如下所示:

$ cat k4.edgelist 
0 1
0 2
0 3
1 2
1 3
2 3

现在,请考虑使用python-igraph:

的以下Python脚本
from igraph import Graph

g=Graph.Full(4)
n=g.induced_subgraph(g.neighbors(0))
print n.get_adjacency().data

h=Graph.Read_Edgelist('k4.edgelist')
n=h.induced_subgraph(h.neighbors(0))
print n.get_adjacency().data

执行时的输出是:

[[0, 1, 1], [1, 0, 1], [1, 1, 0]]
[[0, 1, 1], [0, 0, 1], [0, 0, 0]]

我很困惑,因为我希望第二行与第一行相等。 documentation for get_adjacency()的参数type默认设置为GET_ADJACENCY_BOTH,因此矩阵确实应该是对称的。

是否有直接的方法来获得诱导子图的对称邻接矩阵?我肯定可以通过线性代数来做到这一点,但我关心的矩阵很大,所以我想尽可能高效地做到这一点。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

你制作了有向图。做一个无向的:

h=Graph.Read_Edgelist('k4.edgelist', directed=False)