Question

使用的最佳文件格式是什么？如何正确加载数据库并在python中绘制sgnals 我正在使用https://physionet.org/physiobank/database/mitdb/中的.dat文件我用过这些代码

import numpy as np 
import matplotlib.pyplot as plt 
data = np.genfromtxt('100.dat',delimiter=',')
print(data)

我收到了这个错误：

* 1867行，genfromtxt 提出ValueError（errmsg）

ValueError：检测到一些错误！第3行（有2列而不是1列）第6行（有4列而不是1列）第9行（有3列而不是1列）第11行（有3列而不是1列）第12行（有2列而不是1列）第16行（有3列而不是1列）第17行（有2列而不是1列）第18行（有3列而不是1列）第20行（有2列而不是1列）第23行（有2列而不是1列）第27行（有2列而不是1列）第36行（有2列而不是1列）第37行（有2列而不是1列）第66行（有2列而不是1列）第67行（有2列而不是1列）＃100行（有2列而不是1列）线＃105（有2列而不是1列）第106行（有2列而不是1列）第118行（有2列而不是1列）第120行（有5列而不是1列）第122行（有3列而不是1列）第123行（有4列而不是1列）线＃125（有2列而不是1列）第126行（有2列而不是1列）第127行（有3列而不是1列）第128行（有2列而不是1列）＃134行（有2列而不是1列）＃135行（有2列而不是1列）第137行（有2列而不是1列）＃141行（有3列而不是1列）第143行（有3列而不是1列）第146行（有2列而不是1列）第147行（有2列而不是1列）＃148行（有2列而不是1列）第149行（有2列而不是1列）第＃152行（有3列而不是1列）第154行（有2列而不是1列）＃156行（有4列而不是1列）＃162行（有2列而不是1列）第163行（有2列而不是1列）＃167行（有3列而不是1列）第168行（有2列而不是1列）第＃174行（有2列而不是1列）第175行（有2列而不是1列）第176行（有3列而不是1列）＃177行（有2列而不是1列）第＃179行（有2列而不是1列）＃186行（有2列而不是1列）第187行（有3列而不是1列）第188行（有2列而不是1列）＃189行（有3列而不是1列）第191行（有2列而不是1列）＃193行（有2列而不是1列）第196行（有2列而不是1列）第199行（有2列而不是1列） 202号线（有2列而不是1列）第203行（有2列而不是1列）第204行（有2列而不是1列）线＃209（有4列而不是1列）线＃210（有4列而不是1列）第＃211行（有2列而不是1列）＃213行（有2列而不是1列）第218行（有2列而不是1列）线＃222（有2列而不是1列）第223行（有3列而不是1列）＃228行（有2列而不是1列）第236行（有2列而不是1列）线＃240（有2列而不是1列）第241行（有2列而不是1列）第244行（有3列而不是1列）第246行（有2列而不是1列）第255行（有2列而不是1列）第＃257行（有2列而不是1列）第268行（有2列而不是1列）第269行（有2列而不是1列）第＃271行（有2列而不是1列）第273行（有4列而不是1列）线＃280（有2列而不是1列）第＃281行（有2列而不是1列）第291行（有2列而不是1列）第323行（有2列而不是1列）第325行（有2列而不是1列）＃334行（有2列而不是1列）线＃340（有2列而不是1列）＃341行（有2列而不是1列）＃342行（有2列而不是1列）第364行（有2列而不是1列）第372行（有3列而不是1列）第375行（有2列而不是1列）第378行（有6列而不是1列）*

Answer 1

您应该使用wfdb-python包。文档非常好，并且有很多例子。要在您的环境中安装它，您只需执行pip install wfdb。

假设您在名为100.dat的本地目录中有数据文件（包括上面提到的./mitdb文件），您可以使用以下内容读取记录：

import wfdb
record = wfdb.rdsamp('mitdb/100', sampto=3000)
annotation = wfdb.rdann('sampledata/100', 'atr', sampto=3000)

然后，您可以使用以下函数绘制数据：

wfdb.plotrec(record, annotation = annotation,
         title='Record 100 from MIT-BIH Arrhythmia Database',
         timeunits = 'seconds', figsize = (10,4), ecggrids = 'all')

如果您还没有本地数据文件，可以使用wfdb下载它们：

import os
wfdb.dldatabase('mitdb', os.path.join(os.getcwd, 'mitdb'))

这将下载记录并将其保存在名为mitdb

的本地目录中

在python

1 个答案: