将Tukey的重要字母添加到boxplot

时间:2018-02-05 15:14:38

标签: r posthoc tukey tukeyhsd

我正在尝试使用y轴上的ggplot计数(MedMean)和xaxis上的各种独立样本(Site_Name)创建一个boxplot。

ggplot(medianlist,aes(x = reorder(Site_Name,MedMean,FUN = median),y = MedMean))+ geom_boxplot()

我想在框中添加Tukey的重要字母。

由于

1 个答案:

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使用agricolae::HSD.test即可

library(dplyr)
library(agricolae)
library(ggplot2)
iris.summarized = iris %>% group_by(Species) %>% summarize(Max.Petal.Length=max(Petal.Length))
hsd=HSD.test(aov(Petal.Length~Species,data=iris), "Species", group=T)
ggplot(iris,aes(x=reorder(Species,Petal.Length,FUN = median),y=Petal.Length))+geom_boxplot()+geom_text(data=iris.summarized,aes(x=Species,y=0.2+Max.Petal.Length,label=hsd$groups$groups),vjust=0)

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