Question

我想在访问RcppArmadillo中的矩阵元素时禁用绑定检查。

犰狳的文件说

可以通过编辑文件来配置犰狳包括/ armadillo_bits / config.hpp。具体功能可以通过取消注释或注释掉特定内容来启用或禁用 #define，列在下面。

但是在R包的上下文中，我该如何激活该指令？

我尝试使用

创建config.h文件

#ifndef CONFIG_LOADED
#define CONFIG_LOADED
#define ARMA_NO_DEBUG
#endif

然后将其包含在我的/src文件夹的每个 .cpp文件中，但我不确定它是否正常工作，或者除了添加{之外还有其他方法吗？每个.cpp文件中都有{1}}。

目前我有一个以.cpp开头的.cpp（包含主算法的那个）：

#include "config.h"

然后是其他只是

的人

#include "configs.h"
#include <RcppArmadillo.h>

using namespace Rcpp;
using namespace arma;

// [[Rcpp::export]]
SEXP sample_gibbs_cpp(const arma::vec& v_n, const arma::mat& W, 
arma::vec h_n, double alpha = 1, double beta = 1, int iter=100,
double burnin = 0.5){
... code ...
}

我的描述文件：

#include <RcppArmadillo.h>

using namespace Rcpp;
using namespace arma;
... code ...

我用以下代码编译我的包：

Package: mypackage
Title: What the Package Does (one line, title case)
Version: 0.0.0.9000
Authors@R: person("First", "Last", email = "first.last@example.com", role = c("aut", "cre"))
Description: What the package does (one paragraph).
Depends:
    R (>= 3.2.3)
License: What license is it under?
Encoding: UTF-8
LazyData: true
RoxygenNote: 5.0.1
Imports:
    ggplot2,
    dplyr,
    tidyr,
    rstan
LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo, RcppEigen
SystemRequirements: C++11

Answer 1

订单在这里很重要。在包含#define

之前，必须将此#include<RcppArmadillo.h>声明包含在中
一个例子：

<强> custom_config.h

#ifndef CONFIG_LOADED #define CONFIG_LOADED #define ARMA_NO_DEBUG #endif

<强> example_compiled_file.cpp

#include "custom_config.h" #include <RcppArmadillo.h> // [[Rcpp::export]] void test_pkg(const arma::vec& x) { // Should not trigger error bound checking with debug flag on. double my_val_protected = x(0); // Never triggers error bound checking double my_val = x.at(0); }

注意：由于这是一个软件包，因此不需要使用// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]。相反，您必须在RcppArmadillo文件的Rcpp字段中指定LinkingTo:和DESCRIPTION，并在Rcpp字段中添加Imports:。您必须从Rcpp最低限度地导入一个函数（最好是evalCpp）。

e.g。说明必须：

Imports: Rcpp (>= 0.12.15) LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo

Rc包中的ARMA_NO_DEBUG与RcppArmadillo

1 个答案: