我正在编写Skew算法来构造后缀数组,我有一个长字符串(长度> = 4000)。 在Skew算法中,我必须构建三元组数组和子字符串数组。
例如:我有一个字符串s = 'abcddd'
。
'abc', 'bcd', 'cdd', 'ddd'
'abcddd', 'bcddd', 'cddd', 'ddd', 'dd', 'd'
这是我的解决方案:
import numpy as np
# example
string = 'abdcb.....' (length >= 4000)
temp = 'abdcb......###' (length >= 4000)
triples_arr = np.array([])
sub_strings = np.array([])
for i in range (0, len(temp) - 3):
triples_arr = np.append(triples_arr, temp[i:i + 3])
sub_strings = np.append(sub_strings, string[i:string_len])
使用长字符串(长度> = 4000),需要一分钟才能完成。
是否有任何解决方案可以减少该任务的处理时间?
答案 0 :(得分:2)
使用理解,您可以比使用for
循环更快地构造这些字符串:
triples_arr = [a_string[i:i+3] for i in range(0, len(a_string)-1)]
sub_strings = [a_string[i:] for i in range(len(a_string))]
a_string = 'abcdefghijklmnopqrstuvwxyz'
triples_arr = [a_string[i:i+3] for i in range(0, len(a_string)-2)]
print(triples_arr)
sub_strings = [a_string[i:] for i in range(len(a_string))]
print(sub_strings)
['abc', 'bcd', 'cde', 'def', 'efg', 'fgh', 'ghi', 'hij', 'ijk', 'jkl',
'klm', 'lmn', 'mno', 'nop', 'opq', 'pqr', 'qrs', 'rst', 'stu', 'tuv',
'uvw', 'vwx', 'wxy', 'xyz']
['abcdefghijklmnopqrstuvwxyz', 'bcdefghijklmnopqrstuvwxyz',
'cdefghijklmnopqrstuvwxyz', 'defghijklmnopqrstuvwxyz',
'efghijklmnopqrstuvwxyz', 'fghijklmnopqrstuvwxyz',
'ghijklmnopqrstuvwxyz', 'hijklmnopqrstuvwxyz', 'ijklmnopqrstuvwxyz',
'jklmnopqrstuvwxyz', 'klmnopqrstuvwxyz', 'lmnopqrstuvwxyz',
'mnopqrstuvwxyz', 'nopqrstuvwxyz', 'opqrstuvwxyz', 'pqrstuvwxyz',
'qrstuvwxyz', 'rstuvwxyz', 'stuvwxyz', 'tuvwxyz', 'uvwxyz',
'vwxyz', 'wxyz', 'xyz', 'yz', 'z']
答案 1 :(得分:0)
这可能适用于您,也可能不适合您,但如果您使用bytes
和memoryview
对象而不是字符串对象,则可以使用许多优化。例如,切片内存视图非常便宜。
答案 2 :(得分:0)
没有任何外部库和没有任何循环怎么样?
False, True
输出:
Triples_Array=[]
Sub_strings=[]
def hello(data):
if not data:
return 0
triple=data[:3]
Sub_strings.append(data)
if len(triple)==3:
Triples_Array.append(triple)
return hello(data[1:])
print(hello('abcddd'))
print(Sub_strings)
print(Triples_Array)