使用np.asarray和Biopython get_residues：KeyError

Question

我有一个名为targetChain的Bio.PDB链。这是1nwx的E链。 这就是我的代码：

>>> X = [r for r in targetChain.get_residues()]
>>>
>>> np.asarray(X)

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/opt/python-2.7.12/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/numeric.py", line 531, in asarray
    return array(a, dtype, copy=False, order=order)
  File "/opt/python-2.7.12/lib/python2.7/site-packages/Bio/PDB/Entity.py", line 40, in __getitem__
    return self.child_dict[id]
KeyError: 0

我无法弄清楚出了什么问题。 我正在和我一起工作 蟒-2.7.12

numpy 1.12.0

Bio version 1.70

现在，另一个奇怪的是这个代码适用于另一个PDB结构（例如4m链B）。

另外，我在另一台拥有numpy 1.8.0rcl的机器上试过它，它对我刚提到的两个PDB（1nwxE和4mneB）都很好。