R:phyper理解phyper

时间:2018-01-26 01:48:22

标签: r statistics

我正在尝试使用R中的phyper计算超几何概率,并注意到一种奇怪的行为。我正在研究基因集重叠概率,在一种情况下,没有“成功抽奖”,所以:

x=0
m=430
n=19500
k=2

因为我一般都在寻找过度浓缩,所以我使用:

phyper(0,600,19000,2,lower.tail=FALSE)

得到0.043,这看起来很重要。  然而,选择两个“n”基因应具有

的概率
19500/19930*19499/19929=0.957

所以,不应该将phyper结果大于0.957?

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