R中的共识聚类加

时间:2018-01-16 16:18:59

标签: cluster-analysis hierarchical-clustering consensus

我在从数据集中确定最佳群集数时遇到了两难境地。 我已经获得了ConsensusClusterPlus热图图,但在确定最佳簇数时并不确定。

有人可以帮忙吗?我附上了热图和图表的图片来决定最佳的簇数。似乎k = 3是最佳数字点击此处查看图片图片6,图片4,图片2,图片3,图片7,图片8,图片9,图片10

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

注意,我不是专门讨论这个主题,但目前我也在使用集群集合。所以,请谨慎对待我的论点。

基于图像(2:7),热图显示了2块结构,略微暗示 k = 2。与图9相比,肘部同样表示相同的 k ,因为在两次之后,AUC的变化非常稀少。

此外,如果您还没有阅读,请参阅Monti,Tamayo,Mesirov和Golub的论文(2003)https://link.springer.com/article/10.1023/A:1023949509487使用热图。然而,还要注意热图周围的弱点,例如从数据中导出聚类,而似乎没有,请参阅Şenbabaoğlu等。 (2014)http://www.nature.com/articles/srep06207

我假设你已经找到了答案,所以请尽可能分享你的论点,因为聚类通常是ML中主观类型的类发现的基础。