我发现了类似的问题,但没有解决我的问题:我使用插入方法的插入符合随机森林,然后使用预测来预测我的评估数据。这有效。但是当我试图获得预测概率时,我得到以下错误:
[.data.frame(out ,, obsLevels,drop = FALSE)中的错误:undefined 选择的列
代码(示例)
require(caret)
mtcars$carb <- as.factor(mtcars$carb)
tuneGrid <- expand.grid(mtry = c(10), min.node.size = c(1), splitrule = "extratrees")
rf_model<-train(carb~.,data=mtcars,method="ranger",
trControl=trainControl(method="none")
, tuneGrid = tuneGrid
)
predict(rf_model, mtcars, type="prob")
我确保碳水化合物是其他地方建议的因素。
思想?
答案 0 :(得分:4)
有几个问题。 首先,这种方法要求因子的类级别遵循有效的约定 R变量名,所以将碳水化合物因子的水平重命名为以字母开头是第一步
mtcars$carb <- as.factor(paste0("c",mtcars$carb))
其次,TrainControl中classProbs的默认参数设置为FALSE
。
在你的情况下,这应该是TRUE
。
library("caret")
tuneGrid <- expand.grid(mtry = c(10), min.node.size = c(1), splitrule = "extratrees")
rf_model <- train(carb ~ ., data = mtcars, method = "ranger",
trControl = trainControl(method = "none", classProbs = TRUE),
tuneGrid = tuneGrid)
classprobs <- predict(rf_model, newdata = mtcars, type = "prob")