16个任务(1048.5 MB)的序列化结果总大小大于spark.driver.maxResultSize(1024.0 MB)

时间:2017-12-27 17:38:58

标签: python apache-spark pyspark spark-dataframe

当我将--conf spark.driver.maxResultSize=2050添加到spark-submit命令时,我收到以下错误。

17/12/27 18:33:19 ERROR TransportResponseHandler: Still have 1 requests outstanding when connection from /XXX.XX.XXX.XX:36245 is closed
17/12/27 18:33:19 WARN Executor: Issue communicating with driver in heartbeater
org.apache.spark.SparkException: Exception thrown in awaitResult:
        at org.apache.spark.util.ThreadUtils$.awaitResult(ThreadUtils.scala:205)
        at org.apache.spark.rpc.RpcTimeout.awaitResult(RpcTimeout.scala:75)
        at org.apache.spark.rpc.RpcEndpointRef.askSync(RpcEndpointRef.scala:92)
        at org.apache.spark.executor.Executor.org$apache$spark$executor$Executor$$reportHeartBeat(Executor.scala:726)
        at org.apache.spark.executor.Executor$$anon$2$$anonfun$run$1.apply$mcV$sp(Executor.scala:755)
        at org.apache.spark.executor.Executor$$anon$2$$anonfun$run$1.apply(Executor.scala:755)
        at org.apache.spark.executor.Executor$$anon$2$$anonfun$run$1.apply(Executor.scala:755)
        at org.apache.spark.util.Utils$.logUncaughtExceptions(Utils.scala:1954)
        at org.apache.spark.executor.Executor$$anon$2.run(Executor.scala:755)
        at java.util.concurrent.Executors$RunnableAdapter.call(Executors.java:511)
        at java.util.concurrent.FutureTask.runAndReset(FutureTask.java:308)
        at java.util.concurrent.ScheduledThreadPoolExecutor$ScheduledFutureTask.access$301(ScheduledThreadPoolExecutor.java:180)
        at java.util.concurrent.ScheduledThreadPoolExecutor$ScheduledFutureTask.run(ScheduledThreadPoolExecutor.java:294)
        at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1149)
        at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:624)
        at java.lang.Thread.run(Thread.java:748)
Caused by: java.io.IOException: Connection from /XXX.XX.XXX.XX:36245 closed
        at org.apache.spark.network.client.TransportResponseHandler.channelInactive(TransportResponseHandler.java:146)

添加此配置的原因是错误:

py4j.protocol.Py4JJavaError: An error occurred while calling o171.collectToPython.
: org.apache.spark.SparkException: Job aborted due to stage failure: Total size of serialized results of 16 tasks (1048.5 MB) is bigger than spark.driver.maxResultSize (1024.0 MB)

因此,我将maxResultSize增加到2.5 Gb,但无论如何Spark作业都失败了(上面显示的错误)。 如何解决这个问题?

2 个答案:

答案 0 :(得分:11)

似乎问题是您尝试撤回到驱动程序的数据量太大。您很可能使用收集方法从 DataFrame / RDD 中检索所有值。 驱动程序是一个单一过程,通过收集 DataFrame ,您将所有已在群集中分发的数据提取回一个节点。 这违背了分发它的目的!只有在将数据减少到可管理的数量后才能这样做。

您有两种选择:

  1. 如果您真的需要处理所有这些数据,那么您应该将其保留在执行程序中。使用 HDFS Parquet 以分布式方式保存数据,并使用Spark方法处理群集上的数据,而不是尝试将其全部收回到一个位置。

  2. 如果您确实需要将数据返回给驱动程序,则应检查是否确实需要所有数据。如果您只需要汇总统计信息,那么在调用collect之前在执行程序上计算出来。或者,如果您只需要前100名结果,那么只有收集前100名。

  3. <强>更新

    还有另一个原因可以解决这个不太明显的错误。当您明确调用collect时,Spark将尝试将数据发送回驱动程序。如果您正在使用累加器,广播连接的数据以及有关每个任务的一些小状态数据,它还将发送每个任务的累加器结果。如果您有很多分区(根据我的经验,20k +),您有时会看到此错误。这是一个known issue,做了一些改进,更多in the works

    如果这是你的问题,过去的选项是:

    1. 增加spark.driver.maxResultSize或将其设置为0表示无限
    2. 如果广播联接是罪魁祸首,您可以减少spark.sql.autoBroadcastJoinThreshold以限制广播联接数据的大小
    3. 减少分区数

答案 1 :(得分:0)

原因:由RDD的collect()之类的操作引起,该操作会将大量数据发送给驱动程序

解决方案: 由SparkConf设置:conf.set("spark.driver.maxResultSize", "4g") 要么 由spark-defaults.conf设置:spark.driver.maxResultSize 4g 要么 在调用spark-submit时设置:--conf spark.driver.maxResultSize=4g