错误安装包" kohonen"包装为R

时间:2017-12-21 08:21:28

标签: r installation package failed-installation

我试图安装包" kohonen"这是尝试lauchn时的输出

> require(kohonen)
Le chargement a nécessité le package : kohonen
Error: package or namespace load failed for ‘kohonen’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 impossible de charger l'objet partagé '/home/sebastien/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/libs/Rcpp.so':
  ~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/libs/Rcpp.so: symbol _ZTTNSt7__cxx1118basic_stringstreamIcSt11char_traitsIcESaIcEEE, version GLIBCXX_3.4.21 not defined in file libstdc++.so.6 with link time reference

我试图找出发生了什么,但我没有找到解决方法。我在Ubuntu 14.04上

我看到它可以通过将gcc降级到4.x(可能是4.2,因为使用此gcc版本成功安装在我的latpopo上)来修复它。

目前的版本是:

$ gcc --version
gcc (Homebrew gcc 5.4.0) 5.4.0

我看到你可以安装几个gcc版本,但我不知道如何指定R使用的gcc。

EDIT 我尝试使用gcc 4.8而R使用它。但它并没有解决我的问题...

编辑2

可能是由于GLIBCXX_3.4.21和libstdc ++。so.6 with

但我有GLIBCC3.4.21

sebastien@sebastien-LABOFARM-HP-Z640-Workstation:~/.R$ strings /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX
GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.1
GLIBCXX_3.4.2
GLIBCXX_3.4.3
GLIBCXX_3.4.4
GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.6
GLIBCXX_3.4.7
GLIBCXX_3.4.8
GLIBCXX_3.4.9
GLIBCXX_3.4.10
GLIBCXX_3.4.11
GLIBCXX_3.4.12
GLIBCXX_3.4.13
GLIBCXX_3.4.14
GLIBCXX_3.4.15
GLIBCXX_3.4.16
GLIBCXX_3.4.17
GLIBCXX_3.4.18
GLIBCXX_3.4.19
GLIBCXX_3.4.20
GLIBCXX_3.4.21
GLIBCXX_3.4.22
GLIBCXX_3.4.23
GLIBCXX_3.4.24
sebastien@sebastien-LABOFARM-HP-Z640-Workstation:/usr/lib/x86_64-linux-gnu$ ll libstdc*
    lrwxrwxrwx 1 root root      19 août  20 21:01 libstdc++.so.6 -> libstdc++.so.6.0.24*
    -rwxr-xr-x 1 root root 1114368 août  20 21:15 libstdc++.so.6.0.24*

我终于检查了我的笔记本电脑kohonen包的工作原理,我发现了这个:

-rwxr-xr-x  1 root  wheel  1471104 12 mar  2016 libstdc++.6.0.9.dylib
lrwxr-xr-x  1 root  wheel       21 28 oct  2015 libstdc++.6.dylib -> libstdc++.6.0.9.dylib
lrwxr-xr-x  1 root  wheel       17 28 oct  2015 libstdc++.dylib -> libstdc++.6.dylib

所以基本上我认为我的问题是libstdc ++已经过时了,所以这个包不会起作用。 我试图更新gcc,但它没有更新libstdc ++

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

好了,现在我的一些R包无法再加载了。

错误是一样的;我迷路了

答案 1 :(得分:0)

好的,似乎我的上一次错误修复了原始错误。

我刚删除了每个用户安装的R包。

然后我重新安装了一些软件包,包括kohonen,它可以工作。

也许有些软件包(来自kohonen的依赖项)是使用不同的gcc版本编译器编译的,并且它会破坏所有内容