数据流GCS到BQ问题

时间:2017-12-14 20:59:12

标签: python google-bigquery google-cloud-storage google-cloud-dataflow

以下是这种情况:我在GCS中有一组压缩文件并且有.gz文件扩展名(即000000_ [0-5] .gz)我是试图导入单个BQ表。到目前为止,我一直在从命令行执行命令,但希望使用Dataflow完成此操作,可能会在将来添加一些转换。

压缩GCS文件中的数据是一个复杂的JSON结构,经常更改模式,因此最简单的方法是将整个文件作为TSV引入BigQuery,只有一列,称为record,然后使用JSON_EXTRACT BQ中的函数用于解析需要时所需的值。

问题:我编写了一个Dataflow管道,在这种情况下它将做到最低限度;从GCS读取并写入BigQuery表。但是,当我执行此管道时,我收到一个JSON解析错误,如下所示:

Error while reading data, error message: JSON table encountered too 
many errors, giving up. Rows: 1; errors: 1., error: Error while reading 
data, error message: JSON table encountered too many errors, giving up. 
Rows: 1; errors: 1., error: Error while reading data, error message: 
JSON parsing error in row starting at position 2630029539: Value 
encountered without start of object.

下面是我的Dataflow脚本,其中一些变量是匿名的。

from __future__ import absolute_import

import argparse
import logging
import re
import json

import apache_beam as beam
from apache_beam.io import ReadFromText
from apache_beam.io import WriteToText
from apache_beam.io import Read
from apache_beam.io import WriteToText
from apache_beam.io import WriteToBigQuery
from apache_beam.options.pipeline_options import PipelineOptions
from apache_beam.options.pipeline_options import SetupOptions

def run(argv=None):

  parser = argparse.ArgumentParser()
  parser.add_argument('--input',
                      dest='input',
                      default='gs://BUCKET_NAME/input-data/000000_0.gz',
                      help='Input file to process.')
  known_args, pipeline_args = parser.parse_known_args(argv)
  pipeline_args.extend([
      '--runner=DataflowRunner',
      '--project=GCP_PROJECT_NAME',
      '--staging_location=gs://BUCKET_NAME/dataflow-staging',
      '--temp_location=gs://BUCKET_NAME/dataflow-temp',
      '--job_name=gcs-gzcomp-to-bq1',
  ])

  pipeline_options = PipelineOptions(pipeline_args)
  pipeline_options.view_as(SetupOptions).save_main_session = True
  with beam.Pipeline(options=pipeline_options) as p:

    (p | "ReadFromGCS" >> ReadFromText(known_args.input)
       | WriteToBigQuery('TABLE_NAME', dataset='DATASET_NAME',
           project='GCP_PROJECT_NAME', schema='record:string'))

if __name__ == '__main__':
  logging.getLogger().setLevel(logging.INFO)
  run()

正如您所看到的,我尝试执行与传统加载作业相同的操作,方法是指定仅包含一个字符串类型的列的架构,但它仍然失败。

有没有办法明确告诉Dataflow有关我如何导入GCS文件的更多详细信息?即指定TSV,即使它是每行上的有效JSON对象?

另外,如果这个错误与我可能搞砸的其他任何事情有关,请同样打电话给我;我是Dataflow的新手,但对BQ& amp;其他一些GCP工具,所以希望将它添加到我的工具带中。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

我相信WriteToBigQuery的输入集合应该是字典集合(每个键映射到BigQuery列),而不是字符串集合。尝试传递| beam.Map(lambda line: dict(record=line))

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