我想比较R中4个roc曲线的auc。
我试过了roc.test
,但这个函数只能比较两条曲线
roc.test(roc1,roc2)
R是否具有比较四条曲线的功能?
我知道在stata中我可以通过roccomp
比较4条曲线。有人知道如何比较R中的四条曲线吗?
谢谢!
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我不认为它与roc.test有关,但您可以使用library(caTools)
来完成它。
使用library(pROC)
使用' 来比较下面的AUC值非常容易,我在这里描述了两种方法:
两种方法的示例和设置:
在此处构建模型:
lm1 <- lm(am ~ disp + mpg, data= mtcars)
lm2 <- lm(am ~ disp + hp, data= mtcars)
lm3 <- lm(am ~ disp + wt, data= mtcars)
在此预测模型:
predict1 <- predict(lm1, newdata=mtcars)
predict2 <- predict(lm2, newdata=mtcars)
predict3 <- predict(lm3, newdata=mtcars)
library("caTools")
colAUC(cbind(predict1, predict2, predict3), mtcars$am, plotROC = T)
<强>输出:强>
[,1] [,2] [,3]
0 vs. 1 0.8380567 0.9433198 0.9433198
如果您选择使用plotROC = T
,那么您将收到ROC之间的情节比较
auc.val <- sapply(list(predict1, predict2, predict3),function(x)roc(pred=x,resp=mtcars$am)$auc)
最后使用sapply计算AUC:
library(pROC)
auc.val <- sapply(list(predict1, predict2, predict3),function(x)roc(pred=x,resp=mtcars$am)$auc)
会返回这个:
> auc.val
[1] 0.8380567 0.9433198 0.9433198
如果您有兴趣使用名称打印,请在sapply中使用USE.NAMES
> auc.val <- sapply(list("lm1" = predict1, "lm2" = predict2,"lm3"= predict3),function(x)roc(pred=x,resp=mtcars$am)$auc, USE.NAMES = T)
> auc.val
lm1 lm2 lm3
0.8380567 0.9433198 0.9433198