如何在给定的序列中找到稀有密码子?

时间:2011-01-24 12:15:10

标签: bioinformatics

编写程序以查找序列列表中的稀有密码子的概念是什么?我不是要问任何人的编码。只是想知道这个概念。

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

这里有一些python:

codon = "TAG"

sequence = "AAAAAAAAAATAG"
if sequence.find(codon) != -1:
    #found codon in the string!

答案 1 :(得分:0)

寻找字符串内部的模式是被爱和喜爱的正则表达式存在的理由。

这些表达式中包含表示字符串模式的符号。使用适当构建的正则表达式,您可以在文本中搜索“匹配”正则表达式的任何子文本。这可以让您找到非常复杂的模式并执行许多操作,如拆分,替换等。

希望这有帮助。