转换密码子中的序列

时间:2016-05-08 14:47:53

标签: python bioinformatics

我是一个菜鸟,想知道将DNA序列ATGGTGCCCCAG等转换为密码子的最有效方法是什么:ATG GTG CCC CAG。本质上,我想打印一个包含序列的文件,每个密码子之间有一个空格。输入文件包含数千个开放阅读帧序列(即没有UTR)。

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def splitCode(DNA):
    return ' '.join(DNA[i:i+3] for i in xrange(0,len(DNA),3))