Question

这是this的后续问题。我知道knitr生成的PDF中交叉引用数字和表格的规范方法是使用bookdown::pdf_document2（详情here）。

这太棒了！但是假设我想将我的Rmd发送给没有安装 bookdown 的用户？如果在尚未安装 bookdown 的环境中编织，我如何确保文档呈现？我希望在一个Rmd文件中包含所有内容。该文档的消费者可能是之前很少或根本没有R经验的人，并且刚安装了R和RStudio但没有安装包。如果他们点击编织他们将获得带有交叉引用的PDF，我该如何确保？或者，如果Binder或类似提供了执行（或者，更好地，编译为PDF）Rmd文件的方法，就像使用Jupyter笔记本一样，我希望能够捆绑在Rmd文件本身中以自动方式呈现PDF所需的一切。

示例文档如下所示：

---
title: "Cross-refs test"
author: "Me"
date: "13 December 2017"
output:
  bookdown::pdf_document2:
    citation_package: natbib
    fig_caption: yes
    keep_tex: yes
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

## Title

\begin{equation}
f\left(k\right)=\binom{n}{k}p^k\left(1-p\right)^{n-k} \label{eq:binom}
\end{equation}

You may refer to it using `\@ref(eq:binom)`, e.g., see Equation \@ref(eq:binom).

因此，如果这个Rmd文件是由脑死僵尸或Binder编译下载并编织的，我怎样才能确保不会发生这种情况：

Error in loadNamespace(name) : there is no package called 'bookdown'
Calls: <Anonymous> ... tryCatch -> tryCatchList -> tryCatchOne -> <Anonymous>
Execution halted

我不能假设我的Rmd的消费者会知道在这种情况下该怎么做，也没有任何我无法控制的自动化过程从Rmd渲染PDF，它从某个地方的回购中获取（比如什么Binder确实。）

如果有 no 交叉引用，我可以指定pdf_document作为输出格式，RStudio将读取YAML，如果 knitr 和没有安装rmarkdown ，会自动触发这些安装（用户/脑死僵尸只需点击“确定”接受安装），PDF就会被渲染。所以，如果缺少这两个包：没问题，至少在使用RStudio时。用户获取Rmd，安装R和Rstudio，编织Rmd，然后显示PDF。如果使用 bookdown 来进行交叉引用，则情况并非如此。

似乎在执行R代码之前解释了YAML，因此用于在文档（date: "`r Sys.time()`"）中打印当前时间的this相同的逻辑不起作用。否则，我r install.packages("bookdown")在这里。

那么，有没有一种方法可以在没有书签的情况下进行交叉引用，但是像书本一样简单，优雅，或者是否有某种触发knitr来安装bookdown，以便在遇到{{1}时渲染不会崩溃}？

基本上，我想要的是在针织PDF中进行交叉引用，只需极少的用户干预就可以实现 - “因为我的用户可能是一个脑死亡的僵尸或机器人。

我想避免硬编码交叉引用。而且我宁愿不使用LaTeX。如果可能的话，只需要纯粹的Markdown和一些knitr魔法。

Answer 1

有几种方法可以：

避免技术问题的最简单方法是预先安装“在云端”上的所有内容，并让您的用户使用“云”。例如，您可以安装RStudio Server，并预安装构建文档所需的所有包。然后，您的所有用户都需要一个Web浏览器。如果你要求他们在他们的计算机上本地安装软件包，已经足够复杂来安装R，RStudio和LaTeX，我不相信他们会再安装一件事：{ {1}}。
如果他们必须在本地安装所有内容，并且命令install.packages('bookdown')仍然是一个巨大的痛苦，那么你可以做的是创建一个启用了packrat的RStudio项目（或启用现有项目中的 packrat ）。这应该确保当用户使用此项目时，所有必需的R包都可用。

有关我不希望将此功能向后移植到 rmarkdown 包的原因的更多背景信息，请参阅this Github issue。

knitr：尚未安装预订时的交叉引用方程式，数字和表格？

1 个答案: