Question

我正在尝试从CRAN打包一些R包以在conda环境中使用，因为我正在使用Python和R包的组合来生成信息管道。由于其他依赖性，我需要将R保持在版本3.3

我用Python和R的版本创建了一个全新的环境：

$ conda create -n bioinfo python = 3.6.3 r = 3.3.2

根环境中没有安装R.然后我按照conda骨架的说明进行操作：

（bioinfo）$ conda skeleton cran rootSolve

（bioinfo）$ conda build r-rootolve

出于某种原因，这持续产生R3.4依赖，即使根据CRAN，rootSolve包只需要R＆gt; = 2.01！这是从哪里来的？

将安装以下新软件包： r-base：3.4.2-haf99962_0

虽然构建程序包实际上并没有改变我环境中运行的R版本，但是程序包不会加载。有什么想法吗？

R版本3.3.2（2016-10-31） - ＆＃34;真诚的南瓜补丁＆＃34;

> library('rootSolve')
Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : 
  unable to load shared object '/usr/people/bioc1402/miniconda3/envs/bioinfo2/lib/R/library/rootSolve/libs/rootSolve.so':
  /usr/people/bioc1402/miniconda3/envs/bioinfo2/lib/R/library/rootSolve/libs/rootSolve.so: undefined symbol: R_ExternalPtrAddrFn
In addition: Warning message:
package ‘rootSolve’ was built under R version 3.4.2 
Error: package or namespace load failed for ‘rootSolve’

Answer 1

显然这是一个bug，现在修复了conda-build 3.1.3， https://github.com/conda/conda-build/issues/2562

感谢conda团队！

'conda build r-rootolve --R = 3.3.1'现在适用于conda骨架生成的配方。

conda skeleton cran使用错误的R版本

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