R:Dplyr'group_by'似乎在Shiny中不起作用

时间:2017-12-04 09:51:49

标签: r group-by shiny dplyr metafor

我刚刚开始尝试使用 Shiny ,我在使用 dplyr 'group_by'功能时遇到了问题。

我的一般想法是,我有一个数据集,其中包含许多数值变量和一个变量,通过这些变量可以对这些变量进行分组(在我的情况下是19个国家,因此变量范围从1到19)。 现在,我想使用 metafor 包对每个国家/地区的两个变量之间的相关性进行元分析。 所以我想分别计算每个国家的两个选定变量之间的相关性,然后将它们放在一个荟萃分析中,最后显示这些效应的森林图。

我已经使用mtcars数据集作为我已经走了多远的例子:

UI

library(shiny)
library(metafor)
library(dplyr)


ui <- fluidPage(
  sidebarPanel(

    selectInput("x", label = "Choose Variable I", 
    choices = c("Displacement (cu.in.)", "Horsepower", "Rear axle ratio",
    "Weight (1000lbs)", "1/4 mile time"), selected = "Displacement (cu.in.)"),

    selectInput("y", label = "Choose Variable II", 
    choices = c("Displacement (cu.in.)", "Horsepower", "Rear axle ratio",
    "Weight (1000lbs)", "1/4 mile time"), selected = "Horsepower")
  ),

  mainPanel(
    plotOutput(outputId = "plot")
    ) 
  )

服务器

 server <- function(input, output) {


  output$plot <-renderPlot({

    data_x <- switch(input$x, 
                     "Displacement (cu.in.)" = mtcars$disp,
                     "Horsepower" = mtcars$hp,
                     "Rear axle ratio" = mtcars$drat,
                     "Weight (1000lbs)" = mtcars$wt,
                     "1/4 mile time" = mtcars$qsec)

    data_y <- switch(input$y, 
                     "Displacement (cu.in.)" = mtcars$disp,
                     "Horsepower" = mtcars$hp,
                     "Rear axle ratio" = mtcars$drat,
                     "Weight (1000lbs)" = mtcars$wt,
                     "1/4 mile time" = mtcars$qsec)

    meta_main <- mtcars %>% 
      group_by(gear) %>% 
      summarise(participantID = n(), 
                correlation = cor(data_x, data_y, use = "complete.obs"))


    meta <- rma(ni=participantID, ri=correlation, 
                method="REML", measure="COR", data=meta_main)


    forest(meta) 

  })

}

shinyApp(ui = ui, server = server)

在示例中,我按“齿轮”(有3个级别)进行分组,并选择了变量'Displacement','Horsepower','Rear shaft ratio','Weight'和'1/4英里时间'。

最终输出显示选择小部件以及森林图。 然而,所有“齿轮”水平的相关性是相同的。因此,我怀疑'group_by'功能无法正常工作。

我尝试在网上建议使用'group_by_',但它没有太大变化。

关于'group_by'如何与Shiny合作的任何想法?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

尝试此服务器功能,首先应加载.get()包。

ObservableField