Question

我必须制作一个程序，它从命令参数中获取DNA序列文件和DNA子序列，并在每次子序列及其发生次数时查找。我在第36和42行遇到了strcmp的麻烦。目前我拥有它的方式我通过GDB想出我正在比较字符串的地址而不是实际的字符串。但如果我删除＆amp;我收到一个错误。我不确定这是怎么回事。 TIA

String, length=5

dna.txt：

#include <stdio.h>
#include <string.h>

int main(int argc, char *argv[]) {
    // place subsequence in string
    char *subsequence = argv[2];
    // get length of subsequence
    int seqLength = strlen(subsequence);
    // define file type and open for reading
    FILE *inputFile = fopen(argv[1], "r");
    // get each line using while loop
    char inputLine[200]; // string variable to store each line
    int i, j, lineLength, counter = 0, flag = -1;

    while (fgets(inputLine, 200, inputFile) != NULL) { // loop through each line
        lineLength = strlen(inputLine);

        for (i = 0; i < lineLength; i++) { // loop through each char in the line
            if (strcmp(&inputLine[i], &subsequence[0]) == 0) { 
            // if current char matches beginning of sequence loop through
            // each of the remaining chars and check them against 
            // corresponding chars in the sequence

                flag = 0;

                for (j = i + 1; j - i < seqLength; j++) {
                    if (strcmp(&inputLine[j], &subsequence[j - i]) != 0) {
                        flag = 1;
                        break;
                    }
                }

                if (flag == 0) {
                    counter++;
                }
            }
        }
    }

    fclose(inputFile);
    printf("%s appears %d time(s)\n", subsequence, counter);
    return 0;
}

输入：

GGAAGTAGCAGGCCGCATGCTTGGAGGTAAAGTTCATGGTTCCCTGGCCC

预期产出：

./dnaSearch dna.txt GTA

Answer 1

就这样做：

if (inputLine[i] == subsequence[0]) {
    if (inputLine[j] != subsequence[j - i]) {

您不需要库函数来比较单个字符。

Answer 2

您的字符串inputLine是一个指向字符数组的指针，以字符＆＃39; \ 0＆＃39;终止。

strcmp期待＆＃39; \ 0＆＃39;终止字符串。

传递&inputLine[i]将字符的地址传递到位置＆＃39; i＆＃39;到指针参数和字符串将被读取，直到＆＃39; \ 0＆＃39;字符。

正如评论中所建议的那样，您可以使用普通运算符来比较字符串字符：

if (inputLine[i] == subsequence[0]) {
    flag = 0;
    for (j = i + 1; j - i < seqLength; j++) {// loop
        if (inputLine[j] != subsequence[j - i]) {
            flag = 1;
            break;
        }
    }

或者使用strncmp来比较子字符串：

if (strncmp(&inputLine[i], subsequence, seqLength) == 0) {
    counter++;
}

Answer 3

正如其他人所提到的，您不需要第一次调用strcmp，因为您只检查单个字符。您可以直接比较它们：

if (inputLine[i] == subsequence[0]) {

然而，有一种必须简单的方法来做你想要的。由于您正在寻找另一个字符串中的子字符串，您可以使用strstr函数来执行此操作：

while (fgets(inputLine, 200, inputFile) != NULL) { // loop through each line
    char *sub = inputLine;
    while ((sub = strstr(sub, subsequence) != NULL) {
        counter++;
        sub++;
    }
}

strstr函数将返回字符串内的指针以搜索找到的子字符串，如果没有找到则返回NULL。在上面的代码中，如果找到子字符串，则递增计数器，然后向上移动子字符串指针以继续搜索。

我可以在没有指针的情况下使用strcmp吗？

3 个答案: