嵌套XML到R中的数据框

时间:2017-11-12 22:55:08

标签: r xml

您好我是R和XML文件的新手。

我试图将此XML SOAP响应转换为数据帧:

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<soap:Envelope xmlns:soap="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
  <soap:Body>
    <PrepareDataByClientResponse xmlns="urn:HM-schema">
      <PrepareDataByClientResult>
        <READOUT>
          <SerialNumber>1728527</SerialNumber>
          <Date>1510505992000</Date>
          <Type>1</Type>
          <Value>78.2</Value>
          <Status>OK</Status>
        </READOUT>
        <READOUT>
          <SerialNumber>1728527</SerialNumber>
          <Date>1510509592000</Date>
          <Type>1</Type>
          <Value>76.87</Value>
          <Status>OK</Status>
        </READOUT>
        <READOUT>
          <SerialNumber>1728527</SerialNumber>
          <Date>1510513192000</Date>
          <Type>1</Type>
          <Value>75.61</Value>
          <Status>OK</Status>
        </READOUT>
        <READOUT>
          <SerialNumber>e2ddeed13b4cc4d132f8c6a67d67eed3</SerialNumber>
          <Date>4531528776000</Date>
          <Type>3</Type>
          <Value>230.68</Value>
          <Status>OK</Status>
        </READOUT>
      </PrepareDataByClientResult>
        </PrepareDataByClientResponse>
      </soap:Body>
    </soap:Envelope>

我尝试了几个选项:

xmlout <- do.call(rbind, xpathApply(xmldoc,'//soap:Envelope/soap:Body/PrepareDataByClientResponse', xmlToDataFrame))
xmlout <- as.data.frame(t(xpathSApply(xmldoc,"//readout",function(x) xmlSApply(x,xmlValue))))
xmlout <- as.data.frame(t(xmlSApply(xmldoc["/PrepareDataByClientResponse/PrepareDataByClientResult/READOUT"],xmlAttrs)),stringsAsFactors=FALSE)
xmlout <- ldply(xmlToList(xmldoc), data.frame)

经过SO和其他谷歌搜索的广泛研究,我无法产生预期的结果。我所能得到的只是一个数据框,其中包含一行,所有观察结果都在不同的列中。

我试图找到一个READOUTS表,如:

    SerialNumber    Date            Type    Value    Status
1   1728527         1510505992000   1       78.2     OK
2   1728527         1510509592000   1       76.87    OK
3   1728527         1510513192000   1       75.61    OK

有没有办法让这种表工作?

提前致谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

因为您在<PrepareDataByClientResponse>标记处有一个默认命名空间(即xmlns没有冒号分隔的前缀),所以它的所有子节点都遵循此默认命名空间。

要解析<READOUT>代码,请考虑声明要在getNodeSet()调用中使用的前缀。下面使用 nm 。然后可以在便捷方法xmlToDataFrame中使用这样的调用,它可以轻松地将相对扁平的XML迁移到数据帧中:

library(XML)

doc <- xmlParse('/path/to/SOAP/Response.xml')

df <- xmlToDataFrame(doc, nodes=getNodeSet(doc, "//nm:READOUT",
                                           namespaces=c(nm="urn:HM-schema")))

df
#                       SerialNumber          Date Type  Value Status
# 1                          1728527 1510505992000    1   78.2     OK
# 2                          1728527 1510509592000    1  76.87     OK
# 3                          1728527 1510513192000    1  75.61     OK
# 4 e2ddeed13b4cc4d132f8c6a67d67eed3 4531528776000    3 230.68     OK