假设我有一个Simulation
对象,其核心属性是参数字典,其格式如下:
@pytest.fixture
def param_base():
'''Dict of parameter defaults'''
return {
"fs" : 2e4,
"sweep_length" : 1,
"num_trials" : 300,
...
"pool_tau" : 1.00,
"quantal_size" : -10,
"a_tau" : (0.001,0.005)
}
我想编写一个pytest函数,它只使用每个参数的一系列值运行此模拟。结构略有不同的字典可以封装这个想法:
@pytest.fixture
def param_ranges():
'''Dict of parameter ranges'''
p_name = [
"cav_p_open",
"num_trials",
"num_stim",
"num_cav",
"cav_i",
"num_cav_ratio",
"vesicle_prox",
]
p_sets = [
[0,0.01,0.99,1], #cav_p_open
[1,10,300], #num_trials
[1,2,5], #num_stim
[1,3,10], #num_cav
[0,1,5,10], #cav_i
[1,2], #num_cav_ratio
[0,0.01,0.25,1], #vesicle_prox
]
return dict(zip(p_name,p_sets))
重要的是,我不想运行所有这些参数的所有组合,因为模拟的数量增长得太快了。我一次只想改变一个参数,同时将其他参数保留为默认值。
我目前的解决方案如下(在上述代码之后继续):
parameter_names = [
"cav_p_open",
"num_trials",
"num_stim",
"num_cav",
"cav_i",
"num_cav_ratio",
"vesicle_prox",
]
@pytest.mark.parametrize("p_name", parameter_names)
def test_runModel_range_params(p_name,param_ranges,param_base):
alt_params = copy.deepcopy(param_base)
p_range = param_ranges[p_name]
for i in range(len(p_range)):
alt_params[p_name] = p_range[i]
SIM = utils.Simulation(params = alt_params)
哪个效果很好,但是因为我循环遍历每个参数范围,我只能看到代码是否因为utils.Simulation
在特定参数的某些值处失败而失败,没有知道具体哪个失败了。
所以我认为我正在寻找的是pytest.mark.parameterize
的嵌套版本,我可以在每个参数的每个范围值上运行test_runModel_range_params
。
有什么想法吗?优雅的额外点!
答案 0 :(得分:0)
我认为您正在寻找的是堆叠参数化。来自docs:
要获取多个参数化参数的所有组合,可以堆叠参数化修饰符:
import pytest
@pytest.mark.parametrize("control_var1, control_var2", [(0, 1), ('b','a')])
@pytest.mark.parametrize("default_var1, default_var2", [(2, 3), ('b','a')])
def test_foo(control_var1, control_var2, default_var1, default_var2):
pass