批量下载欧洲PMC元数据

Question

我正在尝试从欧洲PMC数据集下载整个元数据。我可以通过网站提供的rest api下载元数据。但约束是数据量，因此我面临一些性能问题。

最近我已经下载了大约20,000条记录，包含47000个变量。 欧洲PMC拥有约3100万条此类记录。

有什么方法可以使用FTP或更高效的方式下载欧洲PMC数据集？ FTP下载元数据仅适用于现在的开放获取文章

Answer 1

您可以通过FTP下载欧洲PMC上所有全文文章的元数据。

您可以在此处找到所有可用的FTP下载：https://europepmc.org/downloads

包含元数据的元素是所有全文欧洲PMC文章的元数据＆＃39; FTP在这里：https://europepmc.org/ftp/pmclitemetadata/

然后您可以使用HAS_FT:N之类的标志来通过API访问所有其他文章的元数据。不过，它仍然有很多文章。