我通过以下方式指定我的先辈们没有否定:
def lnprior(theta):
sig,mu = theta
if 0.01 < sig < 2.0 and 0.01 < mu < 1.0:
return(0.0)
return(-np.inf)
然后我按照emcee网页上的食谱进行操作:
def lnprob(theta,lightcurve,noisecurve):
lp = lnprior(theta)
if not np.isfinite(lp):
return(-np.inf)
return(lp + lnlike(theta,lightcurve,noisecurve)) # lightcurve and noisecurve are np.arrays
我不会以任何方式改变mu
中的lnlike
(至少不是故意)......
然后当我使用fig = corner.corner(samples, labels=["$\sigma$", "$\mu$",'$c$'],color=sns.xkcd_rgb["amber"])
生成角点图时,角落为corner,我仍会得到几个落在下面两个象限中的点。为什么是这样 ?
以下是我如何定义lnlike:
def lnlike(theta,lightcurve,noisecurve):
sig = theta[0]
mu = theta[1]
lightcurve = adder(lightcurve,mu) #simply adding lightcurve + mu
x = binMaker(mu,lightcurve,noisecurve) # computing x values as a function of mu
y, yerr = detectionFrequency(lightcurve,noisecurve,mu) # a function which computes a real valued number based on f(x,mu,lightcurve,noisecurve)
return(np.sum((y-PDF(x,sig,np.log(mu)))**2/yerr))
答案 0 :(得分:0)
我也遇到过这个问题,即使在之前的地区内进行了步行者的初始化。一个(钝)解决方案是简单地将lnprior中的if语句添加到你的lnlike函数中。
答案 1 :(得分:0)
要获得每个参数在其先前范围内的最佳拟合值,只需将先前范围放入括号(),即
def lnprior(theta):
sig,mu = theta
if (0.01 < sig < 2.0 and 0.01 < mu < 1.0):
return(0.0)
return(-np.inf)
希望这对您有用。请让我进一步了解。