Picard SortSam加速了吗?

时间:2017-10-27 15:23:37

标签: sorting bioinformatics picard

我想知道如何加速picard的SortSam?运行它需要很长时间,我知道GATK可以是多线程的,但我还没有在Picard上找到示例。

我想知道其他人是如何解决这个问题的?

1 个答案:

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不幸的是,由于问题的性质,对随机BAM文件进行排序无法加快速度。这就是该工具无法提供多线程的原因。