R:如何从coxme包中的lmekin中提取r平方

时间:2017-10-25 22:07:13

标签: r mixed-models random-effects

我试图找出具有家庭效应的混合模型与数据的匹配程度。是否有可能从lmekin函数中提取r平方值?如果是这样,是否有可能为每个协变量提取部分r平方值? 例如:

model= lmekin(formula = height ~ score + sex + age + (1 | IID), data = phenotype_df, varlist = kinship_matrix)

我尝试过MuMin软件包,但它似乎与lmekin模型无关。感谢。

1 个答案:

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我可以使用r.squaredLR()函数

library(coxme)
library(MuMIn)
data(ergoStool, package="nlme")  # use a data set from nlme 
fit1 <- lmekin(effort ~ Type + (1|Subject), data=ergoStool)
r.squaredLR(fit1)

(我很确定这样做有效,但有一点很重要,那就是创建一个可重现的示例,这样我就可以运行你的代码进行双重检查,例如我不确定是什么{{1}看起来像,我无法按原样运行你的代码,这是一个很好的资源reprex包。)