Question

我正在尝试使用rJava包从R运行可运行的JAR文件。这个jar必须向/从外部文件夹写入和读取一些文件，这些文件与jar文件本身在同一路径中，如下所示：

mypath/myjar.jar
mypath/folder1
mypath/folder2
mypath/input_file1.txt
mypath/input_file2.txt

如果我通过打开“mypath”中的控制台并以下列方式运行jar来调用它，程序运行正常：

java -jar myjar.jar input_file1.txt input_file2.txt false

但是当我尝试在R中使用rJava运行此代码时，代码在某些时候崩溃，因为它找不到mypath / folder1和mypath / folder2，即使工作目录被正确定义为“mypath” ”

jinit(".",force.init=TRUE) # this starts the JVM
.jaddClassPath("myjar.jar")
jobject <- .jnew("package_name/Main")  ## call the constructor

result_java <- rJava::.jcall(obj = jobject, returnSig = "V", method = "main", c("input_file1.txt","input_file2.txt","false"))

实际上，java程序被调用，它能够实际找到同样在mypath中的输入文件，但由于某种原因在尝试写入mypath中的文件夹（例如folder1和folder2）时崩溃了错误：

Error executing task java.nio.file.NoSuchFileException: folder1/some_file.txt

我真的不知道发生了什么，花了好几个小时。我错过了一些非常明显的东西吗？

Answer 1

当您使用Java运行代码时，您位于mypath内，并且您的代码可以看到位置folder1和folder2。

也许，你应该传递（作为参数）目录的位置，而不是访问Java代码中的folder1，你应该访问显式路径。

result_java <- 
   rJava::.jcall(
     obj = jobject, 
     returnSig = "V", 
     method = "main",
       c( 
         "input_file1.txt",
         "input_file2.txt",
         "false",
         "full_path_to_your_mypath_location"))

然后，在main内，您只需打开full_path_to_your_mypath_location/some_file.txt即可。当您启动R时，您可能不再使用代码进入目录。您也可以尝试更改目录

setwd(full_path_to_your_mypath_location)

从R运行jar时rJava NoSuchFileException

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