使用R中的自组织映射模型(Package kohenon)进行聚类

时间:2017-09-18 05:14:41

标签: r

我想在R中使用kohenon软件包中的kohenon SOM模型来聚类数据。我的数据在cure.csv文件中,有4000行,有两列,如下所示。所有值都是实数。

    curedf <- read.csv('cure.csv',header=F)


data_train_matrix <- as.matrix(scale(curedf))


som_grid <- somgrid(xdim = 20, ydim=20, topo="hexagonal")

som_model <- som(data_train_matrix, 
        grid=som_grid)

并执行以下代码。

X      Y    Cluster
0.99 0.56   1       //line 1
0.32 -0.23  2       //line 2

现在我想保存群集输出但是如何保存。

[
    { id: '1', plate: 'plate1', time: 20 },
    { id: '1', plate: 'plate2', time: 30 },
    { id: '1', plate: 'plate3', time: 30 },
    { id: '2', plate: 'plate4', time: 30 },
    { id: '2', plate: 'plate5', time: 30 },
    { id: '2', plate: 'plate6', time: 30 }
]

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