说我有这样的数据框:
df <- data.frame(year_day = rep(1:365, 3),
year = rep(2001:2003, each = 365),
value = sin(2*pi*rep(1:365, 3)/365))
它表示2001年至2003年期间一年中每一天(value
)的某些值(year_day
)。我想每年绘制一次,并使用ggplot2
这样做。
ggplot(df) + geom_point(aes(year_day, value)) + facet_wrap(~year, ncol=1)
这给了我:
大。现在,假设我想稍微延长我的绘图区域,以便每年包括前一年的3个月和下一年的3个月(如果这些数据存在的话)。这意味着一些数据将被绘制两次。例如,2003年的前三个月将出现在2002年和2003年的图中。因此,我可以复制这些行并将它们分配给2002,但是year-day
的366到485.这是有效的,但是很复杂。有更优雅的解决方案吗?
答案 0 :(得分:0)
这是我一直在考虑的事情,所以这是尝试实施它的充分理由。它仍然涉及重复行,这是很糟糕的,但它是我能想到的最佳方式。
这是一个整齐的可管道功能,它将数据帧(甚至是分组的)作为其第一个参数,并将一列日期作为其第二个参数。有一个可选的第三个参数来扩展每个窗口扩展的范围(默认为0.25或3个月)。第四个论点是财政或学术年代不是1月1月,但我还没有深入思考过那个。
输出是相同的数据框,其中包含多年尾部的重复行,一年中的其他列 doy_wrapped (从负数到> 365),以及 nominal_yr ,这是每个窗口居中的年份。
示例,使用数据集ggplot2::economics
:
library(dplyr)
library(lubridate)
economics %>%
filter(year(date) > 2007)
# A tibble: 88 x 6 date pce pop psavert uempmed unemploy <date> <dbl> <int> <dbl> <dbl> <int> 1 2008-01-01 9963.2 303506 3.4 9.0 7685 2 2008-02-01 9955.7 303711 3.9 8.7 7497 3 2008-03-01 10004.2 303907 4.0 8.7 7822 4 2008-04-01 10044.6 304117 3.5 9.4 7637 5 2008-05-01 10093.3 304323 7.9 7.9 8395 6 2008-06-01 10149.4 304556 5.6 9.0 8575 7 2008-07-01 10151.1 304798 4.4 9.7 8937 8 2008-08-01 10140.3 305045 3.7 9.7 9438 9 2008-09-01 10083.2 305309 4.4 10.2 9494 10 2008-10-01 9983.3 305554 5.4 10.4 10074 # ... with 78 more rows
economics %>%
filter(year(date) > 2007) %>%
wrap_years(date, expand = 3/12)
# A tibble: 136 x 8 # Groups: nominal_yr [8] date pce pop psavert uempmed unemploy nominal_yr doy_wrapped <date> <dbl> <int> <dbl> <dbl> <int> <dbl> <dbl> 1 2008-01-01 9963.2 303506 3.4 9.0 7685 2008 1 2 2008-02-01 9955.7 303711 3.9 8.7 7497 2008 32 3 2008-03-01 10004.2 303907 4.0 8.7 7822 2008 61 4 2008-04-01 10044.6 304117 3.5 9.4 7637 2008 92 5 2008-05-01 10093.3 304323 7.9 7.9 8395 2008 122 6 2008-06-01 10149.4 304556 5.6 9.0 8575 2008 153 7 2008-07-01 10151.1 304798 4.4 9.7 8937 2008 183 8 2008-08-01 10140.3 305045 3.7 9.7 9438 2008 214 9 2008-09-01 10083.2 305309 4.4 10.2 9494 2008 245 10 2008-10-01 9983.3 305554 5.4 10.4 10074 2009 -90 # ... with 126 more rows
这确实在某种程度上破坏了它;它按顺序将行重复三次,然后将它们重新分配给相邻年份。它保留原始分组,同时为新的 nominal_yr 添加一个(删除可能的孤立尾部,其中缺少中心年份数据)。
economics %>%
filter(year(date) > 2007) %>%
wrap_years(date, expand = 3/12) %>%
ggplot(aes(doy_wrapped, unemploy)) +
geom_line() + facet_wrap(~nominal_yr, ncol = 3)
然后有几个技巧来装扮它并纠正轴:
economics %>%
filter(year(date) > 2007) %>%
wrap_years(date, expand = 3/12) %>%
ggplot(aes(doy_wrapped + ymd("1900-01-01") - 1, unemploy)) +
geom_line() + facet_wrap(~nominal_yr, ncol = 2) +
geom_vline(xintercept = as.numeric(c(ymd("1900-01-01"), ymd("1901-01-01")))) +
scale_x_date(date_breaks = "2 months",date_labels = "%b",
name = NULL, expand = c(0,0) +
theme_minimal() +
theme(panel.spacing.x = unit(1, "cm"))
+ ymd("1900-01-01") - 1
中的aes(...)
是任意的,您只是希望它与1月1日对齐,以便每年都有正确的月份。然后将其与垂直线中的xintercept =
匹配。
理想情况下,这最终将成为wrap_*
函数系列的一部分,持续四分之一,几个月,几小时,几十年等。
功能代码:
wrap_years <- function(df, datecol, expand = 0.25, offset = "2001-01-01") {
if(!is.data.frame(df)) {return(df)}
datecol <- enquo(datecol)
if(expand > 1) {
warning(paste0("Window expansions of > 1 are not supported."))
return(df)
}
if(!(quo_name(datecol) %in% names(df))) {
warning(paste0("Column '", quo_name(datecol), "' not found in data."))
return(df)
}
# offset <- as_date(offset)
# warning(paste0("Using ", stamp("August 26", orders = "md")(offset),
# " as start of year. Not yet implemented."))
if(!is.Date(df %>% pull(!!datecol))) {
warning(paste0("Use lubridate functions to parse '",
quo_name(datecol),
"' before proceeding."))
return(df)
}
df %>%
mutate(adj_wrap = list(-1:1)) %>%
tidyr::unnest() %>%
mutate(nominal_yr = year(!!datecol) - adj_wrap,
doy_wrapped = yday(!!datecol) + 365*adj_wrap) %>%
filter(between(doy_wrapped, -expand * 365, (1 + expand) * 365)) %>%
select(-adj_wrap) %>%
group_by(nominal_yr, add = T) %>%
filter(sum(year(!!datecol) != nominal_yr) != length(nominal_yr))
}
我曾经假设复制最少行数是最快的方法,这是我第一次尝试它的范例。稍后考虑一下,我意识到一种更天真的方法是简单地复制所有行,结果证明要快得多。然后使用between
完成过滤步骤,这也很快。此版本的功能大约是以前版本速度的2倍(但是绘制原始数据的速度约为0.01倍)。