Question

我使用dendogram中的scipy.cluster.hierarchy函数生成树形图。我创建了树形图并使用它绘制它：

linkage_matrix = ward(dist) 
dendrogram(linkage_matrix, orientation="left", labels=names) 

plt.tight_layout()
plt.show()

到目前为止一切正常。我想要做的是更新树形图的叶标签并绘制新的树状图。我试过两种方法：

使用此处提及的leaf_label_func：here

但这不太好用。我收到n不存在的错误，实际上是True。函数中没有n。

手动更新名称的树状图列表，然后将其添加到树形图中。

`

    linkage_matrix = ward(dist)

dend = dendrogram(linkage_matrix, orientation="left", labels=names)

leaf_names = dend['ivl']

for idx, item in enumerate(leaf_names):
    if 'c' in item:
        item = item+'_c'
        leaf_names[idx] = item

    if 'i' in item:
        item = item+'_i'
        leaf_names[idx] = item

dend['ivl'] = leaf_names


plt.tight_layout()
plt.show()

`

然而，显示的图仍然是树形图的旧版本，但如果我print(dend)，新的叶子名称似乎就在那里。我在这做错了什么？

Answer 1

更新dendogram的示例，您可以根据自己的需要进行更新：

from matplotlib import pyplot as plt
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage
import numpy as np
from pylab import *
import time
ion()
for i in range(10):  
    #update here your dendogram values :
    dist=[12.12,15.485,18.45,4.4,13.684,float(i+1)]
    Z=linkage(dist)
    # calculate it again :
    dendrogram(Z, orientation="left") 
    # draw it again :
    draw()
    #wait 1 second between two update :
    pause(1)

用matplotlib绘制更新的树状图

1 个答案: