给定矩形(x1, y1)
和(x2, y2)
以及两个半径r1
和r2
的两个相对角,找到半径定义的圆之间的点的比率r1
和r2
到矩形中的总点数。
简单的NumPy方法:
def func_1(x1,y1,x2,y2,r1,r2,n):
x11,y11 = np.meshgrid(np.linspace(x1,x2,n),np.linspace(y1,y2,n))
z1 = np.sqrt(x11**2+y11**2)
a = np.where((z1>(r1)) & (z1<(r2)))
fill_factor = len(a[0])/(n*n)
return fill_factor
接下来,我尝试使用来自numba的jit
装饰器来优化此功能。当我使用时:
nopython = True
功能更快,输出正确。但是当我还添加:
parallel = True
功能更快但结果错误。
我知道这与我的z
矩阵有关,因为它没有正确更新。
@jit(nopython=True,parallel=True)
def func_2(x1,y1,x2,y2,r1,r2,n):
x_ = np.linspace(x1,x2,n)
y_ = np.linspace(y1,y2,n)
z1 = np.zeros((n,n))
for i in range(n):
for j in range(n):
z1[i][j] = np.sqrt((x_[i]*x_[i]+y_[j]*y_[j]))
a = np.where((z1>(r1)) & (z1<(r2)))
fill_factor = len(a[0])/(n*n)
return fill_factor
测试值:
x1 = 1.0
x2 = -1.0
y1 = 1.0
y2 = -1.0
r1 = 0.5
r2 = 0.75
n = 25000
其他信息:Python版本:3.6.1,Numba版本:0.34.0 + 5.g1762237,NumPy版本:1.13.1
答案 0 :(得分:1)
parallel=True
的问题在于它是一个黑盒子。 Numba甚至不保证它会实际并行化。它使用启发式方法来确定它是否可并行化以及可以并行完成的内容。这些可能会失败,在您的示例中,它们会失败,就像在my experiments with parallel
and numba中一样。这使parallel
不值得信任,我会建议反对使用它!
在较新版本(0.34)中添加了prange
,您可以获得更多运气。在这种情况下无法应用它,因为prange
的工作方式与range
类似,而且与np.linspace
不同...
只需注意:您可以完全避免构建z
并在函数中执行np.where
,您可以明确地执行检查:
import numpy as np
import numba as nb
@nb.njit # equivalent to "jit(nopython=True)".
def func_2(x1,y1,x2,y2,r1,r2,n):
x_ = np.linspace(x1,x2,n)
y_ = np.linspace(y1,y2,n)
cnts = 0
for i in range(n):
for j in range(n):
z = np.sqrt(x_[i] * x_[i] + y_[j] * y_[j])
if r1 < z < r2:
cnts += 1
fill_factor = cnts/(n*n)
return fill_factor
与你的功能相比,这也应该提供一些加速,甚至可能比使用parallel=True
更多(如果它能正常工作)。