给定一个数组:
In [122]: arr = np.array([[1, 3, 7], [4, 9, 8]]); arr
Out[122]:
array([[1, 3, 7],
[4, 9, 8]])
并给出其指数:
In [127]: np.indices(arr.shape)
Out[127]:
array([[[0, 0, 0],
[1, 1, 1]],
[[0, 1, 2],
[0, 1, 2]]])
我如何能够将它们整齐地堆叠在一起以形成新的2D阵列?这就是我想要的:
array([[0, 0, 1],
[0, 1, 3],
[0, 2, 7],
[1, 0, 4],
[1, 1, 9],
[1, 2, 8]])
这是我目前的解决方案:
def foo(arr):
return np.hstack((np.indices(arr.shape).reshape(2, arr.size).T, arr.reshape(-1, 1)))
它有效,但是有什么更短/更优雅来进行此操作吗?
答案 0 :(得分:2)
使用array-initialization
然后broadcasted-assignment
在后续步骤中分配索引和数组值 -
def indices_merged_arr(arr):
m,n = arr.shape
I,J = np.ogrid[:m,:n]
out = np.empty((m,n,3), dtype=arr.dtype)
out[...,0] = I
out[...,1] = J
out[...,2] = arr
out.shape = (-1,3)
return out
请注意,我们避免使用np.indices(arr.shape)
,这可能会减慢速度。
示例运行 -
In [10]: arr = np.array([[1, 3, 7], [4, 9, 8]])
In [11]: indices_merged_arr(arr)
Out[11]:
array([[0, 0, 1],
[0, 1, 3],
[0, 2, 7],
[1, 0, 4],
[1, 1, 9],
[1, 2, 8]])
<强>性能强>
arr = np.random.randn(100000, 2)
%timeit df = pd.DataFrame(np.hstack((np.indices(arr.shape).reshape(2, arr.size).T,\
arr.reshape(-1, 1))), columns=['x', 'y', 'value'])
100 loops, best of 3: 4.97 ms per loop
%timeit pd.DataFrame(indices_merged_arr_divakar(arr), columns=['x', 'y', 'value'])
100 loops, best of 3: 3.82 ms per loop
%timeit pd.DataFrame(indices_merged_arr_eric(arr), columns=['x', 'y', 'value'], dtype=np.float32)
100 loops, best of 3: 5.59 ms per loop
注意:计时包括转换为pandas
数据框,这是此解决方案的最终用例。
答案 1 :(得分:2)
nd数组的更通用的答案,正确处理其他dtypes:
def indices_merged_arr(arr):
out = np.empty(arr.shape, dtype=[
('index', np.intp, arr.ndim),
('value', arr.dtype)
])
out['value'] = arr
for i, l in enumerate(arr.shape):
shape = (1,)*i + (-1,) + (1,)*(arr.ndim-1-i)
out['index'][..., i] = np.arange(l).reshape(shape)
return out.ravel()
这将返回一个带有索引列和值列的结构化数组,该列可以是不同的类型。