我有一个蜥蜴撤退站点的数据集，我想用r中的nmds来检查，以确定哪些变量可能很重要。我是r的新手，被告知我需要对数据进行编码，以便r可以读取它。我正在使用OS X 10.9.5（13F1911，r版本R 3.3.3 GUI 1.69 Mavericks build（7328）。
我不确定如何附加数据文件，所以我在这里复制了'head'（数据）：
data <- data.frame(newdataset)
head(data)
Hide.. PIT Year Species Alive.Partial.Dead Standing.half.fallen.fallen X..days.obs Total...of.day.occupied Height Diameter Angle Aspect
1 1 91A1 2004 Hog Doctor A S 6 6 4.2 ? . ?
2 2 91A1 2004 Mammie A S 4 4 1.8 5-10cm 90 SW
3 3 COFE 2004 Tabebuia riparia A S 17 16 3 5-10cm 0 ENE
4 4 COFE 2004 Columar cactus P Fallen 2 2 0 5-10cm 90 S
5 5 COFE 2004 ? D Fallen 4 3 0.2 5-10cm 60 ?
6 6 COFE 2004 Eugenia sp (check greeny fruit) P S 7 7 3.5 10-20cm 0 W
正如您所见，我设法将数据读入r，但我不确定接下来是什么？我知道我需要将我的data.frame（newdataset）转换为距离矩阵，但我不清楚是否必须为某些变量编码或创建级别，例如，如果撤退站点（由蜥蜴选择）是在一棵树上，1。活着，2。部分死亡，3。死亡。
关于变量的更多信息 - 第1栏。隐藏（撤退）识别蜥蜴选择的每个撤退，即，一个蜥蜴可以使用单个或多个撤退，第2列。无效的内部应答器识别号，唯一识别每个蜥蜴，第3列收集数据的年份，4。物种是指撤退所在的树种，或者是单个蜥蜴使用的基质（岩石），5。确定树是活着的，部分存活的还是死的， 6.确定树是直立的，是否倾斜，或者是否躺在地上，7。使用特定的撤退地点观察蜥蜴的天数，8。撤退的总天数已知使用的场地，9。从地面撤退场地的高度，10。包含撤退场地的树的直径，11。撤退场地相对于地面的角度，12。角度撤退地点相对于地面。
感谢任何可以就此问题提供建议的人。
干杯 瑞克