Question

导入rpy2.robjects时，出现以下错误。它说我必须设置R_HOME环境变量或将R解释器的目录添加到PATH。但我不知道如何处理它。你是如何解决的？我该怎么办？

问题只出现在空闲状态，而不是bash，sublime，pycharm或notebook！

PS：我有R（3.4）和rpy2（2.8.6），在mac下，导入rpy2没有错误

PSS：我试过PATH =“/ Library / Frameworks / R.framework / Versions / 3.4 / Resources / bin：{PATH}” 出口PATH。但我失败了。

>>> import rpy2.robjects as robjects

追踪（最近一次通话）：文件“”，第1行，in 将rpy2.robjects导入为robjects 文件“/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/rpy2/robjects/init.py”，第16行，in 将rpy2.rinterface导入为rinterface 文件“/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/rpy2/rinterface/init.py”，第81行， “”“） RuntimeError：无法确定R主目录。

Try to install R <https://www.r-project.org/>,
set the R_HOME environment variable to the R home directory, or
add the directory of the R interpreter to the PATH environment variable.

Answer 1

也许您在闲置环境中使用的Python环境与bash，sublime，pycharm和Notebook中的环境不同。我建议使用anaconda来管理多个环境。然后根据here的建议，在要使用rpy2的python环境中设置R_HOME环境变量。

Answer 2

你是如何解决的？我该怎么办？

打开终端，写“R --version”，按回车键。如果你有R，在同一个终端输入“python”（import rpy2.robjects就可以了）。如果R --version未找到R，则未设置PATH或未安装R。

使用Docker和其中一个Docker镜像的替代方法。

导入rpy2（子模块）

2 个答案: