Question

我想使用rpy2包。当我导入不属于标准库的R的PortfolioAnalytics库时，我不再获得任何输出。（我在Windows上直接从Idle运行我的python代码，而不是通过Windows控制台运行（因为我在下面概述的问题）。）

示例：

第一个代码正常工作：

    import rpy2.robjects as robjects
    from rpy2.robjects.packages import importr

    print 'check output 1'
    utils = importr("utils")        # 'utils' belongs to the standard lib

    print 'check output 2'

输出：

    check output 1
    check output 2

到目前为止一切顺利。但是在下面的示例中它将不再起作用。

第二段代码不起作用：

    import rpy2.robjects as robjects
    from rpy2.robjects.packages import importr

    print 'check output 1'
    utils = importr("PortfolioAnalytics", lib_loc = "C:\username\Documents\R\win-library\3.3")

    print 'check output 2'

输出：

    check output 1

附加说明： 我不确定以下是否与问题有关：当我想使用Windows控制台执行我的代码时，我收到错误

    RuntimeError: R_USER not defined.

（我已将R的bin目录添加到PATH变量中。）无论如何，这不是我的紧急问题。我只想添加这些信息，以防它可能与我的问题有关。

Answer 1

这应该是评论，但我还不能写评论。

我试图重现你的错误，我无法解决。以下是我的想法：

在Windows上安装R时，我被迫设置了R_USER。我不知道你是如何解决这个问题的，但我认为这样做是个好主意。
有不同版本的R可用。最新的（R 3.3.0）确实将R.dll存储在this post中指定的目录中，这应该是R_HOME应该指向的。我在其他地方看到人们使用更高级目录（.../R/R-x.y.z/）或不同目录（.../R/R-x.y.z/bin/i386）。如果它导致问题，您可能想尝试其中一个。
将包含R.dll的目录添加到PATH变量似乎也是一个好主意。
我能想到的最后一件事是关于你对lib_loc的使用。虽然rpy2的文档指出importr的此选项应指向库，但Portfolio Portfolio的CRAN page指出必须编译包。可能不太可能，您的软件包是否可以通过（例如）install.packages("PortfolioAnalytics")安装，或者至少不正确？在这种情况下，您的lib_loc值可能指向正确的目录，但实际上并未编译库。

大致我的所作所为：

安装R
安装Python
下载并安装visual c++ compiler for python
设置R_HOME和R_USER环境变量，并将包含R.dll的目录添加到我的PATH。
使用R命令行安装PortfolioAnalytics（及其所有依赖项）与install.packages("package_name")，并考虑here中接受的答案。

之后，运行代码对我没有任何错误。（在Windows 10上使用Python 2.7和R 3.3.0从命令行，IDLE和Eclipse（PyDev）测试。）

如果这对您没有帮助，也许您可以分享一些有关您目前尝试过的内容的更多信息。

编辑：我能够部分重现所描述的行为，它似乎与lib_loc的使用有关。似乎没有importr的详细文档，也没有使用lib_loc的详细文档。在确保正确安装软件包之后，我尝试使用lib_loc参数指定其位置。以下目录都是为此目的的无效值：

/ R_DIR /文库
/ R_DIR /库/ PortfolioAnalytics
/ R_DIR /库/ PortfolioAnalytics /库
/ R_DIR /库/ PortfolioAnalytics /库/ 64
/ R_DIR /库/ PortfolioAnalytics /库/ I386

我检查过的全部内容。但是，我很确定，将程序包安装到/R_DIR/library（由于Windows限制，如果R未安装在任何系统目录中，如Program Files，则效果最佳）应该不必指定{ {1}}。如果我是正确的，这是一个可行的解决方法，特别是如果您刚开始设置R环境。

实际上，lib_loc命令（我认为）在某些时候出现了另一个问题并且已经解释过here。如链接中所述，这与Windows中缺少的importr功能有关，并由Preet Kukreti的回答为我解决。

rpy2：导入非标准R库的R库时没有输出

1 个答案: