奇点绑定文件

Question

我用我的脚本创建了一个奇点图像。我需要使用带有脚本参数的本地文件来运行我的应用程序。为此，我想使用--bind参数。如果我尝试这样做，它的效果非常好：

singularity run --bind /my/source/file:/destination/file my_app_image.img <input.txt >output.txt

但我想像这样直接运行它：

./my_app_image.img --bind /my/source/file:/destination/file <input.txt >output.txt

但这不起作用 - 文件未安装在目标中。如何在运行时挂载文件？

Answer 1

虽然我使用奇点容器工作了一段时间，但我不知道这是否可行。

如果必须在用例中调用可执行文件，则可以编写一个调用singularity run ...的简短包装脚本，并将该文件绑定到容器中。

您也可以在Singularity user list上提出您的问题。

P.S。我想评论，但没有足够的声誉。

Answer 2

您可以在调用容器（如可执行文件）之前导出绑定目录/文件。

 export SINGULARITY_BINDPATH="/my/source/file:/destination/file"
 ./my_app_image.img <input.txt >output.txt