使用dplyr中的mutate_at

时间:2017-08-11 11:52:20

标签: r dplyr

我有一个包含5列的数据框,我想生成4个额外的列,给出了最后4列和第1列之间的差异。 我尝试了以下方法,但这不起作用:

library(tidyverse)
df <- as.tibble(data.frame(A = c(1,2), B = c(3,4), C = c(4,5), D = c(2,3), E = c(4,5)))
r_diff <- function(x,y){
  z = y - x
  return(z)
}
vars_to_process <- c("B","C","D","E")
df %>% mutate_at(.cols=vars_to_process, .funs =r_diff(.,df[,1])) %>% head()

由于 伦格尔

3 个答案:

答案 0 :(得分:5)

这是最简单的方法。

df %>% 
   mutate_at(.vars = vars(B:E),
             .funs = funs(. - A))

.vars参数允许您以与select()中指定列相同的方式指定列,前提是您将该规范放在函数vars()中。

.funs参数接受在funs()调用内动态定义的匿名函数。在定义此匿名函数时,您可以引用数据框中的列(在本例中为A)。(参见this Stackoverflow question)。

答案 1 :(得分:4)

这是使用基本R代码的更快解决方案。策略转换为矩阵,从所需列中减去第一列,然后构建回数据框。请注意,这只返回已修改的列 - 如果vars_to_process中有列,则它们不会出现在输出中,但您的测试集中没有任何列,所以我'假设它们不存在。

所以,总是尽可能在函数中写东西:

bsr = function(df,vars_to_process){
    m = as.matrix(df)
    data.frame(
         A = m[, 1],
             m[, 1] - m[, vars_to_process])}

制作一些测试数据:

> df = data.frame(matrix(runif(5*1000), ncol=5))
> names(df)=LETTERS[1:5]
> dft = as.tibble(df)
> head(dft)
# A tibble: 6 x 5
          A          B         C         D         E
      <dbl>      <dbl>     <dbl>     <dbl>     <dbl>
1 0.2609174 0.07857624 0.2727817 0.8498004 0.3403234
2 0.3644744 0.95810657 0.8183856 0.2958133 0.4752349
3 0.6042914 0.98793218 0.7547003 0.9596591 0.5354045
4 0.4000441 0.61403331 0.9018804 0.3838347 0.3266855
5 0.6767012 0.11984219 0.9181570 0.5988404 0.6058629

与tidyverse版本比较:

akr = function(df,vars_to_process){
   df %>% mutate_at(vars_to_process, funs(r_diff(.,df[[1]])))
   }

检查bsrakr同意:

> head(bsr(dft, vars_to_process))
          A          B           C           D           E
1 0.2609174  0.1823412 -0.01186432 -0.58888295 -0.07940594
2 0.3644744 -0.5936322 -0.45391119  0.06866108 -0.11076050
3 0.6042914 -0.3836408 -0.15040892 -0.35536765  0.06888696
4 0.4000441 -0.2139892 -0.50183635  0.01620939  0.07335861

> head(akr(dft, vars_to_process))
# A tibble: 6 x 5
          A          B           C           D           E
      <dbl>      <dbl>       <dbl>       <dbl>       <dbl>
1 0.2609174  0.1823412 -0.01186432 -0.58888295 -0.07940594
2 0.3644744 -0.5936322 -0.45391119  0.06866108 -0.11076050
3 0.6042914 -0.3836408 -0.15040892 -0.35536765  0.06888696
4 0.4000441 -0.2139892 -0.50183635  0.01620939  0.07335861

好的,除了akr返回一个tribble但是nm。基准:

> microbenchmark(bsr(dft, vars_to_process),akr(dft, vars_to_process))
Unit: microseconds
                      expr      min        lq      mean   median       uq
 bsr(dft, vars_to_process)  362.117  388.7215  488.9309  446.123  521.776
 akr(dft, vars_to_process) 8070.391 8365.4230 9853.5239 8673.692 9335.613

Base R版本快26倍。我还认为从另一组列中减去一列比应用一个mutator函数更整洁,但只要你在函数中包装你所做的事情,那么胆量是多么混乱无关紧要。

答案 2 :(得分:3)

我们需要使用[[对列进行子集,因为[仍为data.frame

df %>% 
   mutate_at(vars_to_process, funs(r_diff(.,df[[1]]))) 
# A tibble: 2 x 5
#     A     B     C     D     E
#  <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
#1     1    -2    -3    -1    -3
#2     2    -2    -3    -1    -3