我有一个包含5列的数据框,我想生成4个额外的列,给出了最后4列和第1列之间的差异。 我尝试了以下方法,但这不起作用:
library(tidyverse)
df <- as.tibble(data.frame(A = c(1,2), B = c(3,4), C = c(4,5), D = c(2,3), E = c(4,5)))
r_diff <- function(x,y){
z = y - x
return(z)
}
vars_to_process <- c("B","C","D","E")
df %>% mutate_at(.cols=vars_to_process, .funs =r_diff(.,df[,1])) %>% head()
由于 伦格尔
答案 0 :(得分:5)
这是最简单的方法。
df %>%
mutate_at(.vars = vars(B:E),
.funs = funs(. - A))
.vars
参数允许您以与select()
中指定列相同的方式指定列,前提是您将该规范放在函数vars()
中。
.funs
参数接受在funs()
调用内动态定义的匿名函数。在定义此匿名函数时,您可以引用数据框中的列(在本例中为A
)。(参见this Stackoverflow question)。
答案 1 :(得分:4)
这是使用基本R代码的更快解决方案。策略转换为矩阵,从所需列中减去第一列,然后构建回数据框。请注意,这只返回已修改的列 - 如果vars_to_process
中有列列,则它们不会出现在输出中,但您的测试集中没有任何列,所以我'假设它们不存在。
所以,总是尽可能在函数中写东西:
bsr = function(df,vars_to_process){
m = as.matrix(df)
data.frame(
A = m[, 1],
m[, 1] - m[, vars_to_process])}
制作一些测试数据:
> df = data.frame(matrix(runif(5*1000), ncol=5))
> names(df)=LETTERS[1:5]
> dft = as.tibble(df)
> head(dft)
# A tibble: 6 x 5
A B C D E
<dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 0.2609174 0.07857624 0.2727817 0.8498004 0.3403234
2 0.3644744 0.95810657 0.8183856 0.2958133 0.4752349
3 0.6042914 0.98793218 0.7547003 0.9596591 0.5354045
4 0.4000441 0.61403331 0.9018804 0.3838347 0.3266855
5 0.6767012 0.11984219 0.9181570 0.5988404 0.6058629
与tidyverse版本比较:
akr = function(df,vars_to_process){
df %>% mutate_at(vars_to_process, funs(r_diff(.,df[[1]])))
}
检查bsr
和akr
同意:
> head(bsr(dft, vars_to_process))
A B C D E
1 0.2609174 0.1823412 -0.01186432 -0.58888295 -0.07940594
2 0.3644744 -0.5936322 -0.45391119 0.06866108 -0.11076050
3 0.6042914 -0.3836408 -0.15040892 -0.35536765 0.06888696
4 0.4000441 -0.2139892 -0.50183635 0.01620939 0.07335861
> head(akr(dft, vars_to_process))
# A tibble: 6 x 5
A B C D E
<dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 0.2609174 0.1823412 -0.01186432 -0.58888295 -0.07940594
2 0.3644744 -0.5936322 -0.45391119 0.06866108 -0.11076050
3 0.6042914 -0.3836408 -0.15040892 -0.35536765 0.06888696
4 0.4000441 -0.2139892 -0.50183635 0.01620939 0.07335861
好的,除了akr
返回一个tribble但是nm。基准:
> microbenchmark(bsr(dft, vars_to_process),akr(dft, vars_to_process))
Unit: microseconds
expr min lq mean median uq
bsr(dft, vars_to_process) 362.117 388.7215 488.9309 446.123 521.776
akr(dft, vars_to_process) 8070.391 8365.4230 9853.5239 8673.692 9335.613
Base R版本快26倍。我还认为从另一组列中减去一列比应用一个mutator函数更整洁,但只要你在函数中包装你所做的事情,那么胆量是多么混乱无关紧要。
答案 2 :(得分:3)
我们需要使用[[
对列进行子集,因为[
仍为data.frame
df %>%
mutate_at(vars_to_process, funs(r_diff(.,df[[1]])))
# A tibble: 2 x 5
# A B C D E
# <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
#1 1 -2 -3 -1 -3
#2 2 -2 -3 -1 -3