使用Python 2列出索引超出范围错误

时间:2017-08-04 08:47:40

标签: python python-2.7 bioinformatics

我将上面的代码作为更大代码的一部分来进行一些解析和更多一点。每当我运行代码时,我都会收到以下错误消息“list index out of range”。我打印了文件夹所以我看到了它们,我得到以下打印:

  

“的 velvet_results2 / velvet_results_assembly / my_sample_velvet

”。  在my_sample_velvet文件夹中是我需要解析的xml文件。有人可以帮我解决这个问题吗?

matches_counts={}
velvet_folders = glob.glob(velvet_output +'/*')
for folder in velvet_folders:
    print folder
    xml_file=glob.glob(folder + '/*.xml')[0]
    matches = parsing_blast(xml_file,opts.length_cutoff)

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